Alfa-litik endopeptidaza - Alpha-lytic endopeptidase
| Alfa-litik endopeptidaza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||||
| EC raqami | 3.4.21.12 | ||||||||
| CAS raqami | 37288-76-9 | ||||||||
| Ma'lumotlar bazalari | |||||||||
| IntEnz | IntEnz ko'rinishi | ||||||||
| BRENDA | BRENDA kirish | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme ko'rinishi | ||||||||
| KEGG | KEGG-ga kirish | ||||||||
| MetaCyc | metabolik yo'l | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB tuzilmalar | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Alfa-litik endopeptidaza yoki Alfa-litik proteaz (EC 3.4.21.12, miksobakter alfa-litik proteinaz, alfa-litik proteinaz, alfa-litik proteaz, Mycobacterium sorangium alfa-litik proteinaz, Myxobacter 495 alfa-litik proteinaz) an ferment dan ajratilgan miksobakteriya Lizobakter fermentlari.[1][2][3][4] Ushbu ferment a serin proteaz bu katalizlar sinishi peptid bog'lari yordamida gidroliz kimyoviy reaktsiya. Alfa-litik proteaz kuzatilgan parchalanish asosida nomlandi o'ziga xoslik tetrapeptid komponentining a pozitsiyasi uchun grammusbat bakterial hujayra devorlari (alanin ). Alfa-litik proteaz ham elastin va boshqa oqsillarni hazm qilishga qodir.
Ushbu proteaz yaqinda ishlab chiqarish uchun proteom hazm qilish uchun qo'llanildi peptidlar uchun mass-spektrometriya asoslangan proteomika,[5] Bu erda bir nechta kichik aminokislotalardan, shu jumladan, alanin, serin, treonin, valin va oz miqdordagi metionindan keyin ajralib chiqishi aniqlandi. Bu o'ziga xoslik proteomika uchun eng ko'p ishlatiladigan proteazdan ancha farq qiladi, tripsin, bu faqat arginin va lizindan keyin ajralib chiqadi.
Alfa-litik proteaz yaqinda endogen xaritalash usulining bir qismi sifatida foydali dasturni topgani haqida xabar berilgan edi SUMO proteomdagi modifikatsiya joylari.[6]
Adabiyotlar
- ^ Olson MO, Nagabhushan N, Dviniel M, Smilli LB, Whitaker DR (oktyabr 1970). "Alfa-litik proteazning birlamchi tuzilishi: me'da osti bezi serin proteazalarining bakterial homologi". Tabiat. 228 (5270): 438–42. doi:10.1038 / 228438a0. PMID 5482494.
- ^ Polgar L (1987). "Serin proteazalarining tuzilishi va funktsiyasi". Neuberger A-da, Broklexerst K (tahrir). Yangi kompleks biokimyo: gidrolitik fermentlar. 16. Amsterdam: Elsevier. 159-200 betlar.
- ^ Epstein DM, Wensink PC (1988 yil noyabr). "Lizobakter enzimogenlarining alfa-litik proteaz geni. Nukleotidlar ketma-ketligi boshqa ximotripsinga o'xshash fermentlarning pro-peptidlariga homologiyasi bo'lgan katta prepro-peptidni bashorat qiladi". Biologik kimyo jurnali. 263 (32): 16586–90. PMID 3053694.
- ^ Bone R, Frank D, Kettner CA, Agard DA (sentyabr 1989). "O'ziga xoslikning strukturaviy tahlili: reaktsiya oraliq mahsulotlarining analoglari bo'lgan alfa-litik proteaz komplekslari". Biokimyo. 28 (19): 7600–9. doi:10.1021 / bi00445a015. PMID 2611204.
- ^ Meyer JG, Kim S, Maltbi DA, Gassemian M, Bandeira N, Komives EA (mart 2014). "Ortogonal o'ziga xos a-litik proteazlar bilan proteom qoplamini kengaytirish". Molekulyar va uyali proteomika. 13 (3): 823–35. doi:10.1074 / mcp.M113.034710. PMC 3945911. PMID 24425750.
- ^ Lumpkin RJ, Gu X, Zhu Y, Leonard M, Ahmad AS, Klauzer KR, Meyer JG, Bennett EJ, Komives EA (oktyabr 2017). "Mahalliy sharoitda SUMO ning endogen modifikatsiyasini saytga xos identifikatsiya qilish va miqdorini aniqlash". Tabiat aloqalari. 8 (1): 1171. doi:10.1038 / s41467-017-01271-3. PMC 5660086. PMID 29079793.
Tashqi havolalar
- Alfa-litik + endopeptidaza AQSh Milliy tibbiyot kutubxonasida Tibbiy mavzu sarlavhalari (MeSH)
