C6orf201 - C6orf201 - Wikipedia

C6orf201
Identifikatorlar
TaxalluslarC6orf201, dJ1013A10.5, xromosoma 6 ochiq o'qish ramkasi 201
Tashqi identifikatorlarMGI: 1914011 HomoloGene: 23555 Generkartalar: C6orf201
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 6 (odam)
Chr.Xromosoma 6 (odam)[1]
Xromosoma 6 (odam)
C6orf201 uchun genomik joylashuv
C6orf201 uchun genomik joylashuv
Band6p25.2Boshlang4,079,206 bp[1]
Oxiri4,130,951 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

404220

66761

Ansambl

ENSG00000185689

ENSMUSG00000021415

UniProt

Q7Z4U5

Q497N7

RefSeq (mRNA)

NM_001085401
NM_206834

NM_025750

RefSeq (oqsil)

NP_001078870

NP_080026

Joylashuv (UCSC)Chr 6: 4.08 - 4.13 MbChr 13: 34.92 - 34.96 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Xromosoma 6 ochiq o'qish ramkasi 201, C6orf201, a oqsil bu ichida odamlar tomonidan kodlangan C6orf201 gen.[5]Yilda odamlar bu gen a uchun kodlaydi yadro oqsili bu birinchi navbatda moyak.[6][7]

Gen

Yilda odamlar, gen 51,558 ga teng tayanch juftliklari uzoq. The stenogramma eng uzoq ishlab chiqaradigan oqsil 140 dan aminokislotalar ishlov berilmagan tilidan tarjima qilingan mRNA oltitasi bor exons va 1664 yil nukleotidlar uzunligi bo'yicha.[8][9]

C6orf201-gen

Taxalluslar

Xromosoma 6 ochiq o'qish ramkasi 201 (C6orf201) dJ1013A10.5, MGC87625, RP5-1013A10.5 va LOC404220 deb ham nomlanadi.[10]

Lokus

C6orf201 joylashgan xromosoma 6 6p25.2 holatida va ortiqcha plyonkada kodlangan.[11] C6orf201 yaqinida joylashgan FAM217A gen va ECI2 gen.[12]

Tabiatni muhofaza qilish

C6orf201 yuqori darajada saqlanib qolgan primatlar, boshqasida o'rtacha darajada saqlanib qolgan sutemizuvchilar, shuningdek, bir nechtasida konservatsiya mavjud sudralib yuruvchilar.[13] Ichida etarli darajada konservatsiya mavjud mikoplazma bo'lishi mumkin degan gallinarum gorizontal genlarning uzatilishi davomida biron bir voqea evolyutsion tarix C6orf201. Yo'q paraloglar yoki genlarning takrorlanishi C6orf201 uchun tadbirlar.

Ortologlar

Gomologik ro'yxat

Gomologik domenlar

C6orf201 DUF4523 (Pfam15023) ga tegishli bo'lib, funktsional jihatdan tavsiflanmagan oilaga kiradi. oqsillar bu topilgan sutemizuvchilar.[14]

Oqsil

Ismlar

C6orf201ning kamroq tarqalgan nomlari oqsil ular: oqsil MGC87625, faraziy oqsil LOC404220, OTTHUMP00000213693 va OTTHUMP00000213725.[10]

Umumiy xususiyatlar / xususiyatlar

Odamlarda eng uzun oqsil variant 140 ga teng aminokislotalar uzoq,[15] bor molekulyar og'irlik 16.2 dan kDa,[16] va an izoelektrik nuqta 10.88 dan.[16] C6orf201 a bo'lishi taxmin qilinmoqda yadro oqsili.[7]

O'zgartirish va tuzilish

C6orf201 bir nechta taxmin qilingan PKC va CKII fosforillanish saytlar odamlar.[17] The oqsil Shuningdek, a yadroviy lokalizatsiya signali.[7] C6orf201 konservalangan alfa spirali va saqlangan beta strand ichida oqsil.[16]

Proteinlarning o'zaro ta'siri

C6orf201 bilan o'zaro aloqada SRPK1,[18] TMEM106B,[19] va APP.[20]

Ifoda

C6orf201 birinchi navbatda moyak ning odamlar va shuningdek moyak kattalar uchun sichqonlar va kalamushlar.[6] GEO mikroarray ma'lumotlar shuningdek, C6orf201 ning moyaklaridagi ifodasini qo'llab-quvvatlaydi odamlar va sichqoncha.[21][22]

Moyaklardagi eng yuqori ekspresyonni ko'rsatadigan turli xil inson to'qimalarida C6orf201 ifodasi.
Sichqonchaning turli to'qimalarida C6orf201 ning ekspressioni moyakdagi eng yuqori ekspressionni ko'rsatadi.

Klinik ahamiyati

Tadqiqot natijalari

A toksikologiya Tadqiqot shuni ko'rsatdiki, C6orf201 - tartibga solinmagan 20 ta eng yaxshi mahsulotlardan biri genlar yilda maymunlar ta'sirlangan payvandlash uzoq vaqt davomida tutun.[23] Boshqa bir ishda a dan keyin gen ekspressioni o'rganildi metilatsiya inhibitori, C6orf201 ko'plardan biri genlar tekshirildi.[24]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000185689 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000021415 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, Edvards CA, Ashurst JL, Wilming L va boshq. (2003 yil oktyabr). "DNKning ketma-ketligi va inson xromosomasining tahlili 6". Tabiat. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 yil natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID  14574404.
  6. ^ a b "EST profili". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi. Olingan 9 may 2015.
  7. ^ a b v Nakai, Kenta. "PSORT II prognozi". GenScript. Olingan 9 may 2015.
  8. ^ "GeneKartalar: inson geni kompendiumi". Olingan 8 fevral 2015.
  9. ^ "Homo sapiens xromosomasi 6 ochiq o'qish ramkasi 201 (C6orf201) mRNA". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi. Olingan 9 may 2015.
  10. ^ a b "Homo sapiens geni C6orf201, kodlash xromosomasi 6 ochiq o'qish ramkasi 201". NCBI: AceView. Olingan 9 may 2015.
  11. ^ "Genomatix". Olingan 9 may 2015.
  12. ^ "NCBI geni: C6orf201 geni". Olingan 8 fevral 2015.
  13. ^ "Asosiy tekislashni qidirish vositasi". NCBI BLAST.
  14. ^ "Oila: DUF4523 (PF15023)". Evropa bioinformatika instituti. Olingan 26 aprel 2015.
  15. ^ "o'ziga xos bo'lmagan protein C6orf201 [Homo sapiens]". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi. Olingan 9 may 2015.
  16. ^ a b v "Biology WorkBench". San-Diego super kompyuteri. Olingan 9 may 2015.
  17. ^ "Motiflarni skanerlash". ExPASy: SIB Bioinformatics Resurs Portali. Olingan 9 may 2015.
  18. ^ Varjosalo M, Keskitalo S, Van Drogen A, Nurkkala H, Vichalkovski A, Aebersold R, Gstaiger M (aprel 2013). "Inson CMGC kinaz guruhining oqsil bilan o'zaro ta'sir landshafti". Hujayra hisobotlari. 3 (4): 1306–20. doi:10.1016 / j.celrep.2013.03.027. PMID  23602568.
  19. ^ Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N va boshq. (2014 yil noyabr). "Odamlarning interaktomalar tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi". Hujayra. 159 (5): 1212–1226. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.050. PMC  4266588. PMID  25416956.
  20. ^ Olax J, Vincze O, Virok D, Simon D, Bozso Z, Tokesi N, Horvat I, Xlavanda E, Kovach J, Magyar A, Szũcs M, Orosz F, Penke B, Ovadi J (sentyabr 2011). "Patologik belgilarning o'zaro ta'siri: protein / p25, beta-amiloid va alfa-sinukleinni rivojlantiruvchi tubulin polimerizatsiyasi". Biologik kimyo jurnali. 286 (39): 34088–100. doi:10.1074 / jbc.M111.243907. PMC  3190826. PMID  21832049.
  21. ^ "C6orf201 Kichik hujayrali o'pka saratoni - Homo sapiens". Milliy Biotexnologiya Markazi Axborot qidirish ma'lumotlar bazasi. Olingan 9 may 2015.
  22. ^ "C6orf201 Turli to'qimalar - Mus mushaklari". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi. Olingan 9 may 2015.
  23. ^ Xeo JD, Oh JH, Li K, Kim CY, Song CW, Yoon S, Xan JS, Yu IJ (mart 2010). "Sinomolgus maymunlarining o'pka to'qimalarida payvandlash bug'lari qayta-qayta ta'sirlanishiga javoban gen ekspressioni". Toksikologiya arxivi. 84 (3): 191–203. doi:10.1007 / s00204-009-0486-z. PMC  2820669. PMID  19936710.
  24. ^ Park GT, Xan J, Park SG, Kim S, Kim TY (2014 yil aprel). "Psoriaz bilan og'rigan bemorlarda CD4 + T hujayralarining DNK metilatsiyasini tahlil qilish". Dermatologik tadqiqotlar arxivi. 306 (3): 259–68. doi:10.1007 / s00403-013-1432-8. PMID  24323136. S2CID  25754439.