D-stereospetsifik aminopeptidaza - D-stereospecific aminopeptidase
| D-aminopeptidaza, domen B | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 okrobaktrum antropiylaridan d-aminopeptidazaning kristalli tuzilishi | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | DAP_B | ||||||||
| Pfam | PF07930 | ||||||||
| Pfam klan | CL0013 | ||||||||
| InterPro | IPR012856 | ||||||||
| SCOP2 | 1ei5 / QOIDA / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| D-aminopeptidaza, domen C | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
okrobaktrum antropiylaridan d-aminopeptidazaning kristalli tuzilishi | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
| Belgilar | DAP_C | ||||||||
| Pfam | PF07932 | ||||||||
| InterPro | IPR012857 | ||||||||
| SCOP2 | 1ei5 / QOIDA / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Molekulyar biologiyada D-stereospetsifik aminopeptidaza (D-aminopeptidaza) EC 3.4.11.19 bu ferment qaysi katalizlar ozod qilish N-terminal D-aminokislota dan peptid, Xaa afzalroq bo'lgan Xaa- | -Yaa- D-Ala, D-ser yoki D-Thr. D-aminokislota amidlari va metil efirlari, shuningdek glitsin amid kabi gidrolizlanadi.
Bu dimerik har biri bilan ferment monomer uch kishidan iborat domenlar. B domeni a hosil qilish uchun tashkil qilingan beta barrel sakkiztadan iborat antiparallel beta-strandlar. U A domeniga, katalitik domenga, sakkizta qoldiq ketma-ketligi va shu bilan bog'liq o'zaro ta'sir qiladi ikkalasi bilan ham domenlar A va C orqali kovalent bo'lmagan obligatsiyalar. Domen B, ehtimol S domenini yaxshi holatda saqlashda ishlaydi o'zaro ta'sir qilish katalitik domen bilan[1] S domeni a hosil qilish uchun tashkil qilingan beta barrel sakkiz antiparalleldan tashkil topgan beta-strandlar. U B domeniga qisqa bog'lovchi ketma-ketlik bilan bog'langan va o'zaro ta'sir qiladi katalitik domen A domeni bilan keng tarqalgan. Gamma pastadir domen C katalitik cho'ntak devorining bir qismini tashkil qiladi; aslida C domeni beriladi deb o'ylashadi substrat va inhibitor fermentga xosligi.
Tashqi havolalar
Adabiyotlar
- ^ Bompard-Gilles S, Remaut H, Villeret V, Prange T, Fanuel L, Delmarcelle M, Joris B, Frere J, Van Beumen J (sentyabr 2000). "Ochrobactrum antropi," penitsillinni taniydigan fermentlar "oilasining yangi a'zosi bo'lgan D-aminopeptidaza kristalli tuzilishi". Tuzilishi. 8 (9): 971–80. doi:10.1016 / S0969-2126 (00) 00188-X. PMID 10986464.
