EPHX1 - EPHX1

EPHX1
Identifikatorlar
TaxalluslarEPHX1, EPHX, EPOX, HYL1, MEH, epoksid gidrolaza 1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 132810 MGI: 95405 HomoloGene: 94 Generkartalar: EPHX1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 1 (odam)
Chr.Xromosoma 1 (odam)[1]
Xromosoma 1 (odam)
Genomic location for EPHX1
Genomic location for EPHX1
Band1q42.12Boshlang225,810,092 bp[1]
Oxiri225,845,563 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE EPHX1 202017 at fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

2052

13849

Ansambl

ENSG00000143819

ENSMUSG000000387777

UniProt

P07099

Q9D379

RefSeq (mRNA)

NM_001291163
NM_000120
NM_001136018

NM_010145
NM_001312918

RefSeq (oqsil)

NP_001299847
NP_034275

Joylashuv (UCSC)Chr 1: 225.81 - 225.85 MbChr 1: 180.98 - 181.02 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Epoksid gidrolaz 1 bu ferment tomonidan kodlangan EPHX1 gen odamlarda.[5][6]

Funktsiya

Epoksid gidrolaza kabi ekzogen kimyoviy moddalarni faollashtirishda ham, zararsizlantirishda ham muhim rol o'ynaydi politsiklik aromatik uglevodorodlar.[6]

Kashfiyot

Mikrosomal epoksid gidrolaza 1 (EPHX1) birinchi marta quyon jigaridan Watabe va Kanehira tomonidan ajratilgan. [7] va keyinchalik inson jigaridan tozalanadi va xarakterlanadi.[8] EPHX1 a / b gidrolazalar turkumiga kiradi [9] va epoksidlarni diollarga aylantiradi.[10]

To'qimalarning tarqalishi

EPHX1 oqsilini asosan membrananing fraktsiyasida topish mumkin endoplazmatik to'r ning evkaryotik hujayralar. Uning sutemizuvchilardagi ifodasi, odatda, jigarda eng yuqori ko'rsatkichdir, keyin buyrak usti bezi, o'pka, buyrak va ichak.[11] U bronxial holda ham topilgan epiteliy hujayralar [12] va yuqori oshqozon-ichak trakti.[13] EPHX1 ifodasi odamlar orasida individual ravishda o'zgaruvchan [14] va u fenobarbital, b-naftoflavon, benzantrasen, trans-stilben oksidi va boshqalar kabi kimyoviy moddalar tomonidan o'rtacha darajada indüklenebilir.[15]

Gen tuzilishi va ontologiya

Inson EPHX1 ortologlar 127 organizmda topilgan. Inson mikrosomal epoksid gidrolaza 1-xromosomada joylashgan EPHX1 geni tomonidan kodlangan (1q42.12).[16][17][18] Uch xil transkripsiya variantlari 5´-tarjima qilinmagan mintaqa uzunligi 455 ta aminokislotalar bilan aniqlangan.

Funktsiya

Konvertatsiya qilish epoksidlar trans-dihidrodiollarga prototipli EPHX1 reaktsiyasini taqdim etadi.[10] EPHX1 substratning o'ziga xos xususiyatiga ega.[19][20] EPHX1 past molekulyar og'irlikdagi kimyoviy moddalarni, masalan, butadien, benzol, stirol va boshqalarni zararsizlantiradi.[21] ammo politsiklik aromatik uglevodorodlar kabi murakkabroq birikmalar genotoksik turlarga nisbatan ancha faollashadi.[22][23]

EPHX1 natriyga bog'liq transport vositasini tashkil qiladi safro kislotalari ichiga gepatotsitlar.[24] Androsten oksidi va epoksiestratrienol endogen EPHX1 substratlari sifatida ko'rsatilgan.[25][26] EPHX1 ham metabolizmga uchraydi endokannabinoid 2-araxidonoylgliserol arakidon kislotasi[27] va endokannabinoid signalizatsiya yo'lida muhim rol o'ynashi mumkin.

Klinik ahamiyati

EPHX1dagi mutatsiyalar bilan bog'liq preeklampsi,[28][29] yuqori qon darajasi safro tuzlari (ya'ni giperxolanemiya),[30] Xomilalik gidantoin sindromi,[31] va difenilgidantoin toksiklik. Funktsional bitta nukleotid polimorfizmlari EPHX1 (SNP) topilgan va tez-tez o'rganilgan.[32] Ikki SNP - Y113H (rs1051740, T337C) va H139R (rs2234922, A416G) - in vitro EPHX1 faolligiga ta'sir ko'rsatgandek [33] va ularning kombinatsiyasi EPHX1 faolligini kamaytirish uchun ishlatilgan.[34] Ammo ularning funktsional ta'siri inson jigar mikrosomalarida tasdiqlanmagan.[35]

Prokarsinogenlarning metabolizmidagi EPHX1 roli va funktsional ta'sirga ega bo'lgan genlarning o'zgarishi tufayli bir qator assotsiatsiya tadqiqotlari o'tkazildi. EPHX1 SNPlari va o'pka, yuqori aerodigestiv trakt, ko'krak va tuxumdonlar saratoni xavfi o'rtasidagi muhim assotsiatsiyalar turli populyatsiyalarda kuzatilgan.[36][37][38][39][40] Meta-tahlillar rs1051740 va rs2234922 SNPlarning o'pka saratoni xavfi bilan tasdiqlangan assotsiatsiyasini tasdiqlaydi.[41][42][43] Ushbu SNPlarning qizilo'ngach va jigar hujayralari saratoni xavfi bilan bog'liqligi yo'qligi haqida meta-tahlillar ham xabar qilingan [44][45]). Genetik jihatdan bashorat qilingan past EPHX1 faolligi chekuvchilarda 47089 daniyalik dan chekuvchilarda tamaki bilan bog'liq saraton rivojlanish xavfi bilan bog'liq edi.[46] Surunkali obstruktiv o'pka kasalligi (KOAH) bilan kasallangan 8259 bemorni va 42,883 ta nazoratni o'z ichiga olgan so'nggi meta-tahlil EPHX1 fenotipining sekin faolligini bashorat qilishning muhim omilidir KOAH Kavkazda, ammo Osiyo aholisida emas.[47] Altsgeymer kasalligi kabi neyrodegeneratsiya patogenezida EPHX1 ekspressionining roli,[48] metamfetamin bilan bog'liq giyohvandlik,[49] epokseikosatrienoik kislotalarning miya metabolizmi [50] taklif qilindi. EPHX1 tomonidan epokseikosatrienoik kislotalarning metabolizmini modulyatsiya qilish, masalan, neyronlarning signal uzatilishiga, vazodilatatsiyaga, yurak-qon tomir gomeostaziga va yallig'lanishiga xalaqit berishi mumkin. EPHX1 haqidagi mavjud bilimlarni klinik dasturlarga aylantirish, shu bilan birga, fermentning kristalli tuzilishining etishmasligi va uning genotipi va fenotipi o'rtasidagi murakkab munosabatlar bilan cheklanadi.

Izohlar

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000143819 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000038776 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Xartsfild JK, Satkliff MJ, Everett ET, Xassett C, Omiecinski CJ, Saari JA (1998). "In situ gibridlash yo'li bilan odamning 1q42.1 xromosomasiga mikrosomal epoksid gidrolaza (EPHX1) 1-topshirig'i". Sitogenet. Hujayra geneti. 83 (1–2): 44–5. doi:10.1159/000015164. PMID  9925921.
  6. ^ a b "Entrez Gen: EPHX1 epoksid gidrolaz 1, mikrosomal (ksenobiotik)".
  7. ^ Vatabe, T; Kanehira, S (1970). "Jigar mikrosomalaridan epoksid gidrolazaning eruvchanligi". Chem Pharm Bull. 18 (6): 1295–1296. doi:10.1248 / cpb.18.1295. PMID  5465293.
  8. ^ Oesch F (1974). "Inson mikrosomal epoksid gidratazasining tozalanishi va o'ziga xosligi". Biokimyo. J. 139 (1): 77–88. doi:10.1042 / bj1390077. PMC  1166253. PMID  4463951.
  9. ^ Ollis DL, Cheah E, Cygler M, Dijkstra B, Frolow F, Franken SM, Harel M, Remington SJ, Silman I, Schrag J (1992). "Alfa / beta gidrolaza katlamasi" (PDF). Protein Eng. 5 (3): 197–211. doi:10.1093 / protein / 5.3.197. PMID  1409539.
  10. ^ a b Oesch F, Kaubisch N, Jerina DM, Deyli JW (1971). "Gepatik epoksid gidrazasi. Substratlar va inhibitorlar uchun struktura-faollik munosabatlari". Biokimyo. 10 (26): 4858–66. doi:10.1021 / bi00802a005. PMID  5134533.
  11. ^ Oesch F, Rafael D, Shvind H, Glatt HR (1977). "Mutagen metabolitlarini boshqarish bilan bog'liq fermentlarni faollashtiruvchi va inaktiv qiluvchi turlarining farqlari". Arch. Toksikol. 39 (1–2): 97–108. doi:10.1007 / BF00343279. PMID  341853.
  12. ^ Coller JK, Fritz P, Zanger UM, Siegle I, Eichelbaum M, Kroemer HK, Mürdter TE (2001). "Mikrosomal epoksid gidrolazaning odamlarda tarqalishi: normal to'qimalarda immunohistokimyoviy tadqiqotlar va yaxshi va xavfli o'smalar". Gistoxim. J. 33 (6): 329–36. doi:10.1023 / A: 1012414806166. PMID  11758809.
  13. ^ Voho A, Metsola K, Anttila S, Impivaara O, Jarvisalo J, Vainio H, Husgafvel-Pursiainen K, Xirvonen A (2006). "EPHX1 gen polimorfizmlari va o'pka saratoniga individual sezgirlik". Saraton Lett. 237 (1): 102–8. doi:10.1016 / j.canlet.2005.05.029. PMID  16005144.
  14. ^ Mertes I, Fleyshmann R, Glatt HR, Oesch F (1985). "Inson jigarida sitosolik va mikrosomal epoksid gidrolaza faolligining individual farqlari". Kanserogenez. 6 (2): 219–23. doi:10.1093 / kanser / 6.2.219. PMID  3971488.
  15. ^ Peng DR, Pacifici GM, Rane A (1984). "Insonning xomilalik jigar madaniyati: epoksid gidrolazalar va aril uglevodorod gidroksilaza bazal faolligi va induktivligi". Biokimyo. Farmakol. 33 (1): 71–7. doi:10.1016 / 0006-2952 (84) 90371-x. PMID  6538414.
  16. ^ Skoda RC, Demierre A, McBride OW, Gonsales FJ, Meyer UA (1988). "Inson mikrosomal ksenobiotik epoksid gidrolazasi. DNKning komplementar ketma-ketligi, COS-1 hujayralarida DNKning yo'naltirilgan ekspressioni va xromosoma joylashuvi". J. Biol. Kimyoviy. 263 (3): 1549–54. PMID  2891713.
  17. ^ Xassett S, Robinzon KB, Bek NB, Omiecinski CJ (1994). "Inson mikrosomal epoksid gidrolaza geni (EPHX1): to'liq nukleotidlar ketma-ketligi va strukturaviy tavsifi". Genomika. 23 (2): 433–42. doi:10.1006 / geno.1994.1520. PMID  7835893.
  18. ^ Xartsfild JK, Satkliff MJ, Everett ET, Xassett C, Omiecinski CJ, Saari JA (1998). "Mikrosomal epoksid gidrolaza (EPHX1) ni odamning 1q42.1 xromosomasiga joyida duragaylash orqali tayinlash1". Sitogenet. Hujayra geneti. 83 (1–2): 44–5. doi:10.1159/000015164. PMID  9925921.
  19. ^ Lu AY, Tomas PE, Rayan D, Jerina DM, Levin V (1979). "Inson jigari mikrosomal epoksid gidrazasini tozalash. Odam va kalamush fermentlarining xususiyatlaridagi farqlar". J. Biol. Kimyoviy. 254 (13): 5878–81. PMID  109443.
  20. ^ Fretland AJ, Omiecinski CJ (2000). "Epoksid gidrolazalar: biokimyo va molekulyar biologiya". Kimyoviy. Biol. O'zaro ta'sir o'tkazish. 129 (1–2): 41–59. CiteSeerX  10.1.1.462.3157. doi:10.1016 / s0009-2797 (00) 00197-6. PMID  11154734.
  21. ^ Decker M, Arand M, Kronin A (2009). "Ksenobiotik metabolizm va signalizatsiya jarayonida sutemizuvchilar epoksid gidrolazalari" (PDF). Arch. Toksikol. 83 (4): 297–318. doi:10.1007 / s00204-009-0416-0. PMID  19340413.
  22. ^ Shou M, Gonsales FJ, Gelboin HV (1996). "Politsiklik aromatik uglevodorodlarning K-mintaqasida stereoelektiv epoksidlanish va gidratlanish cDNA bilan ifodalangan P450 1A1, 1A2 sitoxromlari va epoksid gidrolaza". Biokimyo. 35 (49): 15807–13. doi:10.1021 / bi962042z. PMID  8961944.
  23. ^ Kasson AG, Zheng Z, Porter GA, Gernsi DL (2006). "Mikrosomal epoksid gidroksilaza va glutation S-transferazlarning M1, T1 va P1 genetik polimorfizmlari, chekish bilan o'zaro ta'siri va qizilo'ngach (Barret) adenokarsinomasi xavfi". Saraton kasalligini aniqlash. Oldingi. 30 (5): 423–31. doi:10.1016 / j.cdp.2006.09.005. PMID  17064856.
  24. ^ Ananthanarayanan M, fon Dippe P, Levi D (1988). "Monoklonal antikorlar yordamida gepatotsit Na + ga bog'liq bo'lgan o't kislotasini tashuvchi oqsilni aniqlash". J. Biol. Kimyoviy. 263 (17): 8338–43. PMID  3372528.
  25. ^ Vogel-Bindel U, Bentli P, Oesch F (1982). "Mikrosomal epoksid gidrolazaning endogen roli. Ontogenez, indüksiyon inhibisyonu, to'qimalarning tarqalishi, immunologik xulq va substrat sifatida 16 alfa, 17 alfa-epoksiandrosten-3-on bilan mikrosomal epoksid gidrolazni tozalash". Yevro. J. Biokimyo. 126 (2): 425–31. doi:10.1111 / j.1432-1033.1982.tb06797.x. PMID  7128597.
  26. ^ Newman JW, Morisseau C, Hammock BD (2005). "Epoksid gidrolazalar: ularning roli va lipid metabolizmi bilan o'zaro ta'siri". Prog. Lipid rez. 44 (1): 1–51. doi:10.1016 / j.plipres.2004.10.001. PMID  15748653.
  27. ^ Nithipatikom K, Endsley MP, Pfeiffer AW, Falck JR, Campbell WB (2014). "Mikrosomal epoksid gidrolazaning yangi faoliyati: endokannabinoid 2-araxidonoylgliserol metabolizmi". J. Lipid Res. 55 (10): 2093–102. doi:10.1194 / jlr.M051284. PMC  4174002. PMID  24958911.
  28. ^ Zusterzeel PL, Peters WH, Visser V, Hermsen KJ, Roelofs HM, Steegers EA (2001). "Mikrosomal epoksid gidrolaza genidagi polimorfizm preeklampsiya bilan bog'liq". J. Med. Genet. 38 (4): 234–7. doi:10.1136 / jmg.38.4.234. PMC  1734856. PMID  11283205.
  29. ^ Laasanen J, Romppanen EL, Hiltunen M, Helisalmi S, Mannermaa A, Punnonen K, Heinonen S (2002). "Mikrosomal epoksid gidrolaza genidagi ikkita ekzonik bitta nukleotidli polimorfizm preeklampsiya bilan birgalikda bog'liqdir". Yevro. J. Xum. Genet. 10 (9): 569–73. doi:10.1038 / sj.ejhg.5200849. PMID  12173035.
  30. ^ Zhu QS, Xing V, Qian B, fon Dippe P, Shnayder BL, Fox VL, Levi D (2003). "Giperxolanemiya holatida odamning m-epoksid gidrolaza geni ekspressionini inhibe qilish". Biokimyo. Biofiz. Acta. 1638 (3): 208–16. doi:10.1016 / s0925-4439 (03) 00085-1. PMID  12878321.
  31. ^ Buehler BA, Delimont D, van Vaes M, Finnell RH (1990). "Xomilaning gidantoin sindromi xavfini tug'ruqdan oldin bashorat qilish". N. Engl. J. Med. 322 (22): 1567–72. doi:10.1056 / NEJM199005313222204. PMID  2336087.
  32. ^ "dbSNP". Olingan 29 dekabr 2014.
  33. ^ Xassett C, Aicher L, Sidhu JS, Omiecinski CJ (1994). "Inson mikrosomal epoksid gidrolazasi: genetik polimorfizm va aminokislota variantlarining in vitro funktsional ifodasi". Hum. Mol. Genet. 3 (3): 421–8. doi:10.1093 / hmg / 3.3.421. PMC  4868095. PMID  7516776.
  34. ^ Benhamou S, Reinikainen M, Bouchardy C, Dayer P, Xirvonen A (1998). "O'pka saratoni va mikrosomal epoksid gidrolaza genotiplari o'rtasidagi bog'liqlik". Saraton kasalligi. 58 (23): 5291–3. PMID  9850050.
  35. ^ Xosagrahara, VP; Retti, AE; Xassett, C; Omiecinski, CJ (2004). "Inson mikrosomal epoksid gidrolaza genetik variantlarini funktsional tahlili". Chem Biol o'zaro aloqasi. 150 (2): 149–159. doi:10.1016 / j.cbi.2004.07.004. PMC  4091877. PMID  15535985.
  36. ^ Jourenkova-Mironova N, Mitrunen K, Bouchardy C, Dayer P, Benhamou S, Xirvonen A (2000). "Yuqori faollikdagi mikrosomal epoksid gidrolaza genotiplari va og'iz, tomoq va gırtlak saratonlari xavfi". Saraton kasalligi. 60 (3): 534–6. PMID  10676631.
  37. ^ Sarmanová J, Susova S, Gut I, Mrhalova M, Kodet R, Adámek J, Roth Z, Soucek P (2004). "Ko'krak bezi saratoni: polimorfizmlarning biotransformatsiya fermentlarida ahamiyati". Yevro. J. Xum. Genet. 12 (10): 848–54. doi:10.1038 / sj.ejhg.5201249. PMID  15280903.
  38. ^ Goode EL, White KL, Vierkant RA, Phelan CM, Cunningham JM, Schildkraut JM, Berchuck A, Larson MC, Fridley BL, Olson JE, Webb PM, Chen X, Beesley J, Chenevix-Trench G, Sellers TA (2011). "Ksenobiotik-metabolizm geni polimorfizmlari va tuxumdonlar saratoni xavfi". Mol. Kanserog. 50 (5): 397–402. doi:10.1002 / mc.20714. PMC  3115705. PMID  21480392.
  39. ^ Peres-Morales R, Mendez-Ramirez I, Moreno-Masias H, Mendoza-Posadas AD, Martines-Ramirez OC, Kastro-Ernandes C, Gonsebatt ME, Rubio J (2014). "Meksikalik Mestizo populyatsiyasidan olingan namunadagi nomzod genlar asosida o'pka saratoniga genetik ta'sirchanlik: vaziyatni nazorat qilish". O'pka. 192 (1): 167–73. doi:10.1007 / s00408-013-9536-7. PMID  24357096.
  40. ^ Tan X, U VW, Vang YY, Shi LJ, Chen MW (2014). "EPHX1 Tyr113His va His139Arg qizilo'ngachning saraton xavfi polimorfizmlari: meta-tahlil". Genet. Mol. Res. 13 (1): 649–59. doi:10.4238 / 2014. 28-yanvar. PMID  24615030.
  41. ^ Kiyohara C, Yoshimasu K, Takayama K, Nakanishi Y (2006). "EPHX1 polimorfizmlari va o'pka saratoni xavfi: HuGE tekshiruvi". Epidemiologiya. 17 (1): 89–99. doi:10.1097 / 01.ede.0000187627.70026.23. PMID  16357600.
  42. ^ Liu X, Li XY, Chen XJ, Xuang YJ, Chjan S, Vang J (2013). "EPHX1 A139G polimorfizmi va o'pka saratoni xavfi: meta-tahlil". Shish Biol. 34 (1): 155–63. doi:10.1007 / s13277-012-0523-z. PMID  23055191.
  43. ^ Vang S, Zhu J, Zhang R, Van S, Gu Z (2013). "Mikrosomal epoksid gidrolaz 1 T113C polimorfizmi va o'pka saratoniga moyilligi o'rtasidagi bog'liqlik". Shish Biol. 34 (2): 1045–52. doi:10.1007 / s13277-012-0644-4. PMID  23378225.
  44. ^ Xu JJ, Vang ZT, Li B (2013). "Meta-tahlil qizilo'ngach saratoni xavfi bilan mikrosomal epoksid gidrolaza 1 polimorfizmlari assotsiatsiyasining yo'qligini ko'rsatadi". Genet. Mol. Res. 12 (4): 4540–8. doi:10.4238 / 2013. 15 oktyabr. PMID  24222229.
  45. ^ Duan CY, Liu MY, Li SB, Ma KS, Bie P (2014). "EPHX1 geni polimorfizmlarini gepatotsellulyar karsinoma xavfi bilan birlashmasining etishmasligi: meta-tahlil". Shish Biol. 35 (1): 659–66. doi:10.1007 / s13277-013-1090-7. PMID  23955801.
  46. ^ Li J, Dahl M, Nordestgaard BG (2011). "47000 kishida genetik jihatdan pasaytirilgan mikrosomal epoksid gidrolaza faolligi va tamaki bilan bog'liq saraton". Saraton epidemiyasi. Biomarkers Oldingi. 20 (8): 1673–82. doi:10.1158 / 1055-9965. EPI-10-1165. PMID  21653646.
  47. ^ Li H, Fu WP, Hong ZH (2013). "Mikrosomal epoksid gidrolaza geni polimorfizmlari va surunkali obstruktiv o'pka kasalligi xavfi: keng meta-tahlil". Onkol Lett. 5 (3): 1022–1030. doi:10.3892 / ol.2012.1099. PMC  3576314. PMID  23426996.
  48. ^ Liu, M; Quyosh, A; Shin, EJ; Liu, X; Kim, SG; Runyons, CR; Markesberi, V; Kim, HC; Bing, G (2006). "Mikrosomal epoksid gidrolaza ekspressioni Altsgeymer gipokampusida ko'tariladi va ekzogen beta-amiloid va trimetil-qalay bilan induktsiyalanadi". Eur J Neurosci. 23 (8): 2027–2034. doi:10.1111 / j.1460-9568.2006.04724.x. PMID  16630050.
  49. ^ Shin, EJ; Bing, G; Cha, JS; Kim, TW; Bax, JH; Park, DH; Yamada, K; Nabeshima, T; Kim, HC (2009). "Sichqonlarda metamfetamin ta'sirida dorilarga bog'liqlikda mikrosomal epoksid gidrolazaning roli". J Neurosci Res. 87 (16): 3679–3686. doi:10.1002 / jnr.22166. PMID  19598248.
  50. ^ Marovskiy, A; Burgener, J; Falck, JR; Fritschi, JM; Arand, M (2009). "Sichqon miyasida eriydigan va mikrosomal epoksid gidrolazaning tarqalishi va uning miya epoksiikosatrienoik kislota almashinuviga qo'shgan hissasi". Nevrologiya. 163 (2): 646–661. doi:10.1016 / j.neuroscience.2009.06.033. PMID  19540314.

Qo'shimcha o'qish