Flavotsitoxrom s sulfidli dehidrogenaza - Flavocytochrome c sulfide dehydrogenase

Sulfid-sitoxrom-c reduktaza (flavotsitoxrom c)
PDB 1fcd EBI.jpg
Flavotsitoxromning tuzilishi v binafsha rangli fototrofik bakteriyadan sulfidli dehidrogenaza Alloxromatium vinosum (PDB: 1FCD​).
Identifikatorlar
EC raqami1.8.2.3
Ma'lumotlar bazalari
IntEnzIntEnz ko'rinishi
BRENDABRENDA kirish
ExPASyNiceZyme ko'rinishi
KEGGKEGG-ga kirish
MetaCycmetabolik yo'l
PRIAMprofil
PDB tuzilmalarRCSB PDB PDBe PDBsum
Flavotsitoxrom s sulfidli dehidrogenaza, flavin bilan bog'laydigan
Identifikatorlar
BelgilarFCSD-flav_bind
PfamPF09242
InterProIPR015323
SCOP21fcd / QOIDA / SUPFAM

Flavotsitoxrom v sulfid dehidrogenaza, shuningdek, nomi bilan tanilgan Sulfid-sitoxrom-v reduktaza (flavotsitoxrom) v) (EC 1.8.2.3 ), bu ferment bilan sistematik ism vodorod-sulfid: flavotsitoxrom c oksidoreduktaza.[1][2][3][4][5][6] Bu topilgan oltingugurt -oksidlovchi bakteriyalar binafsha rang kabi fototrofik bakteriyalar Alloxromatium vinosum.[4][7] Ushbu ferment katalizlar quyidagi kimyoviy reaktsiya:

vodorod sulfidi + 2 ferritsitromli v oltingugurt + 2 ferrotsitoxrom c + 2 H+

Bular fermentlar bor heterodimerlar a flavoprotein (fccB Q06530) va dihaem sitoxrom (fccA; Q06529) amalga oshiradigan vodorod sulfidi - mustaqil sitoxrom S kamaytirish. Dixem sitoxrom burmalar har biri o'xshash ikkita domenga mitoxondrial sitoxrom c, ikkitasi bilan haem ichki birlik bilan bog'langan guruhlar. Flavoprotein subbirligi a ga ega glutation beta (3,4) -alfa (3) yadrosidan va alfa + beta sendvichidan tashkil topgan reduktaza o'xshash katlama. The faol sayt flavoprotein subbirligidan a mavjud katalitik ravishda muhim disulfid ko'prigi yuqorida joylashgan pirimidin qismi flavin uzuk. Flavoprotein tarkibiga a kiradi C-terminali flavin bilan biriktirish uchun zarur bo'lgan domen va undan keyin elektronni o'tkazish.[4] Elektronlar flavindan sitoxromdagi gem guruhlaridan biriga o'tkaziladi. Ikkalasi ham FAD va heme C kovalent ravishda oqsil bilan bog'langan.

Adabiyotlar

  1. ^ Kusai K, Yamanaka T (1973 yil noyabr). "Chlorobium thiosulphatophilum tarkibidagi tiosulfat va sulfidning oksidlanish mexanizmlari: sitoxrom c-551 va sitoxrom c-553". Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Bioenergetika. 325 (2): 304–14. doi:10.1016/0005-2728(73)90106-0. PMID  4357558.
  2. ^ Fukumori Y, Yamanaka T (iyun 1979). "Xromatium vinosumning flavotsitoxrom c. Ba'zi fermentativ xususiyatlari va subbirlik tuzilishi". Biokimyo jurnali. 85 (6): 1405–14. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a132467. PMID  222744.
  3. ^ Grey GO, Gaul DF, Knaff DB (1983 yil aprel). "Chromatium vinosumdan ikkita eruvchan c tipidagi sitoxromlarni qisman tozalash va tavsifi". Biokimyo va biofizika arxivlari. 222 (1): 78–86. doi:10.1016/0003-9861(83)90504-0. PMID  6301383.
  4. ^ a b v Chen ZW, Koh M, Van Driessche G, Van Beeumen JJ, Bartsch RG, Meyer TE, Cusanovich MA, Mathews FS (oktyabr 1994). "Binafsha rangli fototrofik bakteriyadan flavotsitoxrom s sulfidli dehidrogenaza tuzilishi". Ilm-fan. 266 (5184): 430–2. doi:10.1126 / science.7939681. PMID  7939681.
  5. ^ de Jong GA, Robertson LA, Kuenen GJ (may 1998). "Alkalifil xemolitoautotrofik oltingugurt oksidlovchi bakteriyalardan sulfid dehidrogenazani tozalash va tavsifi". FEBS xatlari. 427 (1): 11–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00379-2. PMID  9613590. S2CID  2818096.
  6. ^ Kostanjevecki V, Brigé A, Meyer TE, Cusanovich MA, Guisez Y, van Beeumen J (iyun 2000). "Ectothiorhodospira vacuolata binafsha rangli fototrofik oltingugurt bakteriyasidan membrana bilan bog'langan flavotsitoxrom c-sulfidli dehidrogenaza". Bakteriologiya jurnali. 182 (11): 3097–103. doi:10.1128 / jb.182.11.3097-3103.2000. PMC  94494. PMID  10809687.
  7. ^ Quentmeier A, Hellwig P, Bardischewsky F, Wichmann R, Fridrix CG (2004 yil noyabr). "Paracoccus pantotrophus monoxerik flavoprotein SoxF ning sulfidli dehidrogenaza faolligi". Biokimyo. 43 (46): 14696–703. doi:10.1021 / bi048568y. PMID  15544340.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR015323

Tashqi havolalar