Heterodupleks tahlil - Heteroduplex analysis - Wikipedia

Yovvoyi tip va mutant allellarni kuchaytirish va qayta yoqishdan keyin hosil bo'lgan geteroduplekslar va homoduplekslar.

Heterodupleks tahlil (HDA) - bu usul biokimyo aniqlash uchun ishlatiladi nuqtali mutatsiyalar yilda DNK 1992 yildan beri.[1] Geteroduplekslar bor dsDNA molekulalar bir yoki bir nechta mos kelmaydigan juftliklarga ega bo'lganlar, boshqa tomondan homoduplekslar mukammal juftlashgan dsDNA.[1][2] Ushbu tahlil usuli heteroduplekslarning homodupleks DNKga nisbatan harakatchanligini pasayishiga bog'liq.[3] turli xil DNK allellari o'rtasida heteroduplekslar hosil bo'ladi.[4] Yovvoyi va mutantlar bilan kuchaytirilgan DNK aralashmasida mutant allellarda heteroduplekslar, yovvoyi turdagi allellarda homoduplekslar hosil bo'ladi.[5] DNKdagi mutatsiya turiga va darajasiga asoslangan holda heteroduplekslarning ikki turi mavjud. Kichik o'chirish yoki qo'shib qo'yish barqaror va elektron mikroskop bilan tasdiqlangan bo'rtiq tipli heteroduplekslarni hosil qiladi.[6] Bitta asosli almashtirishlar ko'pikli tipdagi geteroduplekslar deb ataladigan beqaror heteroduplekslarni hosil qiladi, chunki past barqarorlik tufayli elektron mikroskopda tasavvur qilish qiyin.[5] HDA CPTR genidagi 3 bp p.F508del o'chirilishini mutatsiyasini tez skrining qilish uchun keng qo'llaniladi.[6]

Adabiyotlar

  1. ^ a b J. Uolles, Endryu (2002). "SSCP / Heterodupleks tahlillari". D. M. Teofilus, Bimal; Rapley, Ralf (tahrir.). PCR mutatsiyasini aniqlash protokollari. Totova, Nyu-Jersi: Humana Press, Totova, Nyu-Jersi. pp.151 - 164. ISBN  0896036170.
  2. ^ Glavach, Damjan; Din, Maykl (1996), Pfeifer, Gerd P. (tahr.), "Geterodupleks tahlillari", DNK zararini va mutatsiyasini aniqlash texnologiyalari, Springer AQSh, 241–251 betlar, doi:10.1007/978-1-4899-0301-3_18, ISBN  978-1-4899-0301-3
  3. ^ F. El-Yazbi, Amira; Vong, Alysha; R. Loppnov, Glen (2017). "Uyg'un bo'lmagan DNKning gibridlanishining lyuminestsent zondasi: mos kelmaydigan joy va soni". Analytica Chimica Acta. 994: 92–99. doi:10.1002 / 0471142905.hg0703s33. PMID  18428333. S2CID  23375627.
  4. ^ Oq, Marga Belle; Karvalo, Magda; Dersi, Devid; O'Brayen, Stiven J.; Dekan, Maykl (1992-02-01). "Geterodupleksli polimorfizm sifatida yagona asosli almashtirishlarni aniqlash". Genomika. 12 (2): 301–306. doi:10.1016/0888-7543(92)90377-5. ISSN  0888-7543. PMID  1740339.
  5. ^ a b Menounos, Panayiotis G.; Patrinos, Jorj P. (2010-01-01), Patrinos, Jorj P.; Ansorge, Vilgelm J. (tahr.), "4-bob - bir qatorli konformatsion polimorfizm va geterodupleksli tahlil orqali mutatsiyani aniqlash", Molekulyar diagnostika (ikkinchi nashr), Academic Press, 45-58 betlar, doi:10.1016 / b978-0-12-374537-8.00004-3, ISBN  978-0-12-374537-8, olingan 2019-12-02
  6. ^ a b Vang, Y. X.; Barker, P .; Griffit, J. (1992-03-05). "Kist fibrozisining yo'q qilinishidagi heterozigotlardan diagnostik heterodupleks DNKlarning vizualizatsiyasi DNKning bo'rtib chiqqan asoslar bilan tutashishini taxmin qiladi". Biologik kimyo jurnali. 267 (7): 4911–4915. ISSN  0021-9258. PMID  1537869.