Irditoksin - Irditoxin - Wikipedia

Irditoksinning tuzilishi, ko'k bo'lagi A, to'q sariq rang B bo'linmasi bilan. Har bir subbirlikda intramolekulyar disulfid birikmalari sariq tayoqchalar sifatida ko'rsatilgan. Dimer interfeysida molekula ichidagi disulfid bog'i yashil va sariq shar shaklida ko'rsatilgan.[1]
Irditoksin subbirligi A
Identifikatorlar
OrganizmBoiga irregularis
Belgilar3NBA
PDB2H7Z
UniProtA0S864
Irdixotin subbirligi B
Identifikatorlar
OrganizmBoiga irregularis
Belgilar3NBB
PDB2H7Z
UniProtA0S865

Irditoksin a uch barmoqli toksin (3FTx) oqsil topilgan zahar ning jigarrang daraxt ilon (Boiga irregularis) va ehtimol boshqa a'zolarda tur Boiga. Bu heterodimer har biri ikkita alohida protein zanjiridan tashkil topgan uch barmoqli oqsil katlamasi, molekulalararo bog'langan disulfid birikmasi. Ushbu tuzilish odatda monomerik bo'lgan 3FTx oqsillari uchun odatiy emas.[1][2][3]

Tuzilishi

Uch barmoqli toksin (3FTx) oqsillari kanonik ravishda taxminan 60-80 dan iborat aminokislotalar qoldiqlari uchta "barmoq" o'xshash tuzilishni o'z ichiga oladi beta strand - to'rtta molekula ichidagi disulfid bog'lari bilan barqarorlashgan yadrodan chiqadigan tarkibidagi ilmoqlar. Irditoksin a kovalent heterodimer unda ikkita subbirlik molekulalararo bog'langan disulfid birikmasi. Har bir kichik birlik uch barmoqli toksin (3FTx) superfamily oqsil va "noan'anaviy" 3FTx subklass bilan chambarchas bog'liq bo'lib, kanonik uchta "barmoq" tsiklining birinchisida qo'shimcha disulfid bog'lanishining mavjudligi bilan tavsiflanadi. Shunday qilib, har bir kichik bo'limda 11 ta mavjud sistein qoldiqlar: yadro disulfid bog'lanishini hosil qiladigan sakkizta kanonik qoldiq, birinchi tsikldagi ikkitasi noan'anaviy disulfidni hosil qiladi va dimerik bog'lanishni hosil qiladi. Irditoksin A va B kichik birliklari 75 va 77 ga teng aminokislotalar qoldiqlari navbati bilan uzun va har biri a bilan yetti qoldiq kengaytmaga ega piroglutamik kislota tarjimadan keyingi modifikatsiya da N-terminali.[1][2]

3FTx superfamilasida Irditoksinning tuzilishi juda g'ayrioddiy.[2] 3FTx oqsillarining aksariyati monomerlardir. Eng yaxshi o'rganilgan istisno kappa-bungarotoksin, juda boshqacha bo'lgan kovalent bo'lmagan homodimer oqsil-oqsilning o'zaro ta'siri sirt;[2] yaqinda tasvirlangan alfa-kobratoksin topilgan boshqa 3FTx oqsillari bilan kovalent homodimerlarni va kam miqdordagi kovalent heterodimerlarni hosil qiladi. bir rangli kobra (Naja kaouthia) zahar.[4] Irditoksinning ikkita kichik birligi uning biologik faolligiga qanday hissa qo'shishi hali aniq emas.[2]

Funktsiya

Irditoksin - bu jigarrang daraxt ilonining zaharli tarkibidagi oqsil va uning tarkibidan to'plangan jigarrang daraxt ilonlarining zahar namunalarida topilgan oqsilning taxminan 10% ni tashkil qiladi. Guam, ular qaerda invaziv turlar. Irditoksinning toksik ta'siri turlarga juda bog'liq; laboratoriya sinovlarida u juda zaharli hisoblanadi kaltakesaklar va qushlar lekin emas sutemizuvchilar. Zaharlanishning molekulyar mexanizmi aniq bo'lmasa-da, irditoksin mustahkam post- hosil qiladi.sinaptik qushda signalizatsiya blokadasi asab-mushak birikmasi.[1]

Kashfiyot va nomenklatura

Irditoksin birinchi marta 2009 yilda zaharli moddalar namunalaridan ajratib olingandan so'ng tasvirlangan jigarrang daraxt ilon. Uning nomi "qisqarishi"B. irmuntazam dimerik toksini ".[1] Boshqalar Boiga turlari va ehtimol boshqa turlari kolubrid ilonlarga ega bo'lishi mumkin gomologik oqsillar.[5]:18

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d e Pawlak J, Mackessy SP, Sixberry NM, Stura EA, Le Du MH, Ménez R, Foo CS, Ménez A, Nirthanan S, Kini RM (fevral, 2009). "Irditoksin, yangi kovalent ravishda bog'langan heterodimerik uch barmoqli toksin, yuqori taksonga xos neyrotoksiklik bilan". FASEB jurnali. 23 (2): 534–45. doi:10.1096 / fj.08-113555. PMID  18952712.
  2. ^ a b v d e Kini RM, Doley R (2010 yil noyabr). "Uch barmoqli toksinlarning tuzilishi, funktsiyasi va evolyutsiyasi: ko'p maqsadli mini oqsillar". Toksikon. 56 (6): 855–67. doi:10.1016 / j.toxicon.2010.07.010. PMID  20670641.
  3. ^ Doley R, Kini RM (sentyabr 2009). "Ilon zaharidagi oqsil komplekslari". Uyali va molekulyar hayot haqidagi fanlar. 66 (17): 2851–71. doi:10.1007 / s00018-009-0050-2. PMID  19495561.
  4. ^ Osipov AV, Rukktooa P, Kasheverov IE, Filkin SY, Starkov VG, Andreeva TV, Sixma TK, Bertrand D, Utkin YN, Tsetlin VI (fevral 2012). "Dimerik a-kobratoksin rentgen tuzilishi: molekulalararo disulfidlarning lokalizatsiyasi va nikotinik atsetilxolin retseptorlari bilan bog'lanishning mumkin bo'lgan tartibi". Biologik kimyo jurnali. 287 (9): 6725–34. doi:10.1074 / jbc.M111.322313. PMC  3307301. PMID  22223648.
  5. ^ Mackessy SP (2010-01-01). Sudralib yuruvchilarning zaharlari va toksinlari haqida ma'lumotnoma. CRC Press. ISBN  9781420008661. OCLC  757355711.