PAXIP1 - PAXIP1

PAXIP1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Inson UniProt qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	3SQD
Identifikatorlar
Taxalluslar	PAXIP1, CAGF29, PACIP1, PAXIP1L, PTIP, TNRC2, CAGF28, PAX o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil 1
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 608254 HomoloGene: 133914 Generkartalar: PAXIP1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 7 (odam)
Oxiri	155,003,124 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• yadro matritsasi; • nukleoplazma; • MLL3 / 4 kompleksi; • hujayra yadrosi; • giston metiltransferaza kompleksi; • xromosoma;
Biologik jarayon	• ionlashtiruvchi nurlanishga javob; • histon H3-K36 metilatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • DNKning rekombinatsiyasi; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • chorion rivojlanishi; • DNKning zararlanishiga javob, p53 sinf mediatori tomonidan signal uzatilishi; • transkripsiya, DNK-andozali; • giston asetilatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • DNKning zararlanishini rag'batlantirishga uyali javob; • vaskulogenez; • izotiplarni almashtirishni ijobiy tartibga solish; • histon H3-K4 metilatsiyasi; • histon H3-K4 metilatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • yog 'to'qimalarining rivojlanishi; • non-homologik qo'shilish orqali ikki zanjirli tanaffusni ta'mirlash; • oqsilni hamma joyda ijobiy tartibga solish; • endotelial hujayralar migratsiyasi; • DNKni tiklash; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyani boshlashni ijobiy tartibga solish; • hujayra siklining G2 / M fazaga o'tishini tartibga solish; • izotiplarning IgG izotiplariga o'tishini ijobiy tartibga solish; • DNKning zararlanish stimuliga javobni ijobiy tartibga solish; • ketma-ketlikka xos DNKni bog'laydigan transkripsiya omilining faolligini salbiy tartibga solish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	22976
	n / a
	ENSG00000157212
	n / a
	Q6ZW49
	n / a
	NM_007349
	n / a
	NP_031375
	n / a
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash

PAX bilan o'zaro ta'sir qiluvchi protein 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi PAXIP1 gen.^[3]^[4]

Funktsiya

Ushbu gen juftlangan quti (PAX) genlar oilasining a'zosi va oltita BRCT (ko'krak bezi saratoni karboksi-terminal) domenlari bilan yadro oqsilini kodlaydi. Ushbu protein genom barqarorligini, xromatinning kondensatsiyalanishini va mitoz orqali rivojlanishni ta'minlashda hal qiluvchi rol o'ynaydi.^[4] Altsgeymer kasalligida oqsilni ta'sir qiluvchi variantlar ham mavjud.^[5]

O'zaro aloqalar

PAXIP1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan PAX2^[6] va TP53BP1.^[7]^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000157212 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Margolis RL, Abraham MR, Gatchell SB, Li SH, Kidwai AS, Breschel TS, Stine OC, Callahan C, McInnis MG, Ross CA (iyul 1997). "inson miyasida uzun CAG trinukleotidi takrorlanadigan cDNAlar". Hum. Genet. 100 (1): 114–22. doi:10.1007 / s004390050476. PMID 9225980. S2CID 25999127.
^ ^a ^b "Entrez Gen: PAXIP1 PAX o'zaro ta'sir qiluvchi (transkripsiya-aktivatsiya sohasi bilan) oqsil 1".
^ Chen JA, Vang Q, Devis-Turak J va boshq. (2015 yil aprel). "Altsgeymer kasalligi, frontotemporal demans va progressiv supranukleer falajni genom bo'yicha multisistral genomlar majmuasi". JAMA nevrologiyasi. 72 (4): 414–22. doi:10.1001 / jamaneurol.2014.4040. PMC 4397175. PMID 25706306.
^ Lechner MS, Levitan I, Dressler GR (2000 yil iyul). "BRT domenini o'z ichiga olgan yangi PTIP oqsili Pax2 bilan o'zaro ta'sir qiladi va faol xromatin bilan bog'liq". Nuklein kislotalari rez. 28 (14): 2741–51. doi:10.1093 / nar / 28.14.2741. PMC 102659. PMID 10908331.
^ Jowsey PA, Doherty AJ, Rouse J (2004 yil dekabr). "Insonning PTIPsi ATM vositasida p53 aktivatsiyasini engillashtiradi va ionlashtiruvchi nurlanishga uyali qarshilikni oshiradi". J. Biol. Kimyoviy. 279 (53): 55562–9. doi:10.1074 / jbc.M411021200. PMID 15456759.
^ Manke IA, Lowery DM, Nguyen A, Yaffe MB (oktyabr 2003). "BRCT oqsillarni yo'naltirishda ishtirok etadigan fosfopeptidni bog'laydigan modul sifatida takrorlanadi". Ilm-fan. 302 (5645): 636–9. doi:10.1126 / science.1088877. PMID 14576432. S2CID 21866417.

Qo'shimcha o'qish

Sanger markazi, The; Vashington universiteti Genomni ketma-ketlik markazi, The (1998). "To'liq inson genomlari ketma-ketligiga". Genom Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Lechner MS, Levitan I, Dressler GR (2000). "BRT domenini o'z ichiga olgan yangi PTIP oqsili Pax2 bilan o'zaro ta'sir qiladi va faol xromatin bilan bog'liq". Nuklein kislotalari rez. 28 (14): 2741–51. doi:10.1093 / nar / 28.14.2741. PMC 102659. PMID 10908331.
Hoffmeister A, Ropolo A, Vasseur S, Mallo GV, Bodeker H, Ritz-Laser B, Dressler GR, Vaccaro MI, Dagorn JC, Moreno S, Iovanna JL (2002). "HMG-I / Y bilan bog'liq bo'lgan protein p8 p300 va Pax2 trans-faollashuvi domeni bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsilga bog'lanib, glyukagon geni promotoridagi Pax2A va Pax2B transkripsiyasi omillarining trans-aktivatsiya faolligini tartibga soladi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (25): 22314–9. doi:10.1074 / jbc.M201657200. PMID 11940591.
Cho EA, Prindle MJ, Dressler GR (2003). "BRCT domenini o'z ichiga olgan protein PTIP mitoz orqali rivojlanish uchun juda muhimdir". Mol. Hujayra. Biol. 23 (5): 1666–73. doi:10.1128 / MCB.23.5.1666-1673.2003. PMC 151700. PMID 12588986.
Manke IA, Lowery DM, Nguyen A, Yaffe MB (2003). "BRCT oqsillarni yo'naltirishda ishtirok etadigan fosfopeptidni bog'laydigan modul sifatida takrorlanadi". Ilm-fan. 302 (5645): 636–9. doi:10.1126 / science.1088877. PMID 14576432. S2CID 21866417.
Jowsey PA, Doherty AJ, Rouse J (2004). "Insonning PTIPsi ATM vositasida p53 aktivatsiyasini engillashtiradi va ionlashtiruvchi nurlanishga uyali qarshilikni oshiradi". J. Biol. Kimyoviy. 279 (53): 55562–9. doi:10.1074 / jbc.M411021200. PMID 15456759.
Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Cho YW, Hong T, Hong S, Guo H, Yu H, Kim D, Gushchzinski T, Dressler GR, Copeland TD, Kalkum M, Ge K (2007). "PTIP tarkibida MLL3 va MLL4 bo'lgan histon H3 lizin 4 metiltransferaza kompleksi bilan bog'lanadi". J. Biol. Kimyoviy. 282 (28): 20395–406. doi:10.1074 / jbc.M701574200. PMC 2729684. PMID 17500065.
Munoz IM, Jowsey PA, Toth R, Rouse J (2007). "HPTIPning BRCT domenlari tomonidan fosfo-epitopni bog'lash DNKning zararlanishiga uyali ta'sirning ko'p jihatlarini boshqaradi". Nuklein kislotalari rez. 35 (16): 5312–22. doi:10.1093 / nar / gkm493. PMC 2018624. PMID 17690115.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 7 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000157212 - Ansambl, 2017 yil may

[2] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid9225980-3] Margolis RL, Abraham MR, Gatchell SB, Li SH, Kidwai AS, Breschel TS, Stine OC, Callahan C, McInnis MG, Ross CA (iyul 1997). "inson miyasida uzun CAG trinukleotidi takrorlanadigan cDNAlar". Hum. Genet. 100 (1): 114–22. doi:10.1007 / s004390050476. PMID 9225980. S2CID 25999127.

[entrez-4] "Entrez Gen: PAXIP1 PAX o'zaro ta'sir qiluvchi (transkripsiya-aktivatsiya sohasi bilan) oqsil 1".

[5] Chen JA, Vang Q, Devis-Turak J va boshq. (2015 yil aprel). "Altsgeymer kasalligi, frontotemporal demans va progressiv supranukleer falajni genom bo'yicha multisistral genomlar majmuasi". JAMA nevrologiyasi. 72 (4): 414–22. doi:10.1001 / jamaneurol.2014.4040. PMC 4397175. PMID 25706306.

[pmid10908331-6] Lechner MS, Levitan I, Dressler GR (2000 yil iyul). "BRT domenini o'z ichiga olgan yangi PTIP oqsili Pax2 bilan o'zaro ta'sir qiladi va faol xromatin bilan bog'liq". Nuklein kislotalari rez. 28 (14): 2741–51. doi:10.1093 / nar / 28.14.2741. PMC 102659. PMID 10908331.

[pmid15456759-7] Jowsey PA, Doherty AJ, Rouse J (2004 yil dekabr). "Insonning PTIPsi ATM vositasida p53 aktivatsiyasini engillashtiradi va ionlashtiruvchi nurlanishga uyali qarshilikni oshiradi". J. Biol. Kimyoviy. 279 (53): 55562–9. doi:10.1074 / jbc.M411021200. PMID 15456759.

[pmid14576432-8] Manke IA, Lowery DM, Nguyen A, Yaffe MB (oktyabr 2003). "BRCT oqsillarni yo'naltirishda ishtirok etadigan fosfopeptidni bog'laydigan modul sifatida takrorlanadi". Ilm-fan. 302 (5645): 636–9. doi:10.1126 / science.1088877. PMID 14576432. S2CID 21866417.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]