Polikistin 1 - Polycystin 1

PKD1
Protein PKD1 PDB 1b4r.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarPKD1, PBP, Pc-1, TRPP1, polikistin 1, o'zaro ta'sir qiluvchi vaqtinchalik retseptorlari potentsial kanali, PC1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 601313 MGI: 97603 HomoloGene: 250 Generkartalar: PKD1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 16 (odam)
Chr.Xromosoma 16 (odam)[1]
Xromosoma 16 (odam)
PKD1 uchun genomik joylashuv
PKD1 uchun genomik joylashuv
Band16p13.3Boshlang2,088,708 bp[1]
Oxiri2,135,898 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Fs.png-da PBB GE PKD1 202328 s

PBB GE PKD1 202327 s da fs.png

Ps.Bng da PBB GE PKD1 216949 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

5310

18763

Ansambl

ENSG00000008710

ENSMUSG00000032855

UniProt

P98161

O08852

RefSeq (mRNA)

NM_000296
NM_001009944

NM_013630

RefSeq (oqsil)

NP_000287
NP_001009944

NP_038658

Joylashuv (UCSC)Chr 16: 2.09 - 2.14 MbChr 17: 24.55 - 24.6 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Polikistin 1 (ko'pincha qisqartiriladi PC1) a oqsil bu ichida odamlar tomonidan kodlangan PKD1 gen [5][6]. Mutatsiyalar PKD1 holatlarining aksariyati bilan bog'liq autosomal dominant polikistik buyrak kasalligi, og'ir irsiy kasallik ning buyraklar buyrak kistalari rivojlanishi va buyrakning og'ir buzilishi bilan tavsiflanadi [7].

Oqsillarning tuzilishi va funktsiyasi

PC1 bilan o'zaro ta'sir qiladi polikistin 2 sitoplazmik spiral-spiral domeni tomonidan.

PC1 membrana bilan bog'langan oqsil 4303 aminokislotalar uzunligi asosan bo'yicha ifodalangan birlamchi siliyum, shuningdek apikal membranalar, birikmalarga yopishadi va desmosomalar [8]. Unda 11 bor transmembranali domenlar, katta N-terminalli domen va qisqa (200 ga yaqin aminokislota) sitoplazmatik C-terminal domeni [8][9]. Ushbu hujayra ichidagi domen PC1 bilan o'zaro aloqada bo'lgan spiral-spiral domenni o'z ichiga oladi polikistin 2 (PC2), membrana bilan bog'langan Ca2+- o'tkazuvchan ion kanali.

PC1 a funktsiyasini bajarish taklif qilingan G oqsillari bilan bog'langan retseptorlari [8][10]. C-terminal domeni turli xil usullar bilan kesilishi mumkin. Bir misolda quyruqning ~ 35 kDa qismi to'planib qolganligi aniqlandi hujayra yadrosi sichqon buyragida suyuqlik oqimi pasayishiga javoban [11]. Boshqa holatda, transkripsiya faollashtiruvchisi va koaktivatori bilan o'zaro aloqada bo'lgan 15 kDa fragmentini olish mumkin. STAT6 va p100, yoki kanonik tarkibiy qismlar Yo'q, signalizatsiya yo'li inhibitiv usulda [12][13].

Insonning PKD1-PKD2 kompleksining tuzilishi tomonidan hal qilingan kriyo-elektron mikroskopi, bu strukturada PKD1 va PKD2 ning 1: 3 nisbatini ko'rsatdi. PKD1 a dan iborat kuchlanishli ionli kanal PKD2 bilan o'zaro ta'sir qiladigan katlama.[14]

PC1 vositachilik qiladi mexanosensatsiya Buyrak epiteliyasidagi birlamchi siliya tomonidan suyuqlik oqimi va artikulyar xaftaga mexanik deformatsiya [15].

Gen

Turli xil izoformlarni kodlovchi splice variantlari qayd etilgan PKD1. Gen oltitasi bilan chambarchas bog'liq pseudogenlar 16p xromosomasida ma'lum bo'lgan takrorlangan mintaqada.[16]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000008710 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000032855 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Xyuz J, Uord CJ, Peral B, Aspinval R, Klark K, San Millan JL, Gamble V, Xarris PC (iyun 1995). "Polikistik buyrak kasalligi 1 (PKD1) geni ko'plab hujayralarni tanib olish sohalariga ega bo'lgan yangi oqsilni kodlaydi". Tabiat genetikasi. 10 (2): 151–60. doi:10.1038 / ng0695-151. PMID  7663510. S2CID  20636101.
  6. ^ "Buyrakning polikistoz kasalligi: PKD1 geni va uning oqsilining to'liq tuzilishi. Xalqaro polikistik buyrak kasalliklari konsortsiumi". Hujayra. 81 (2): 289-98. 1995 yil aprel. doi:10.1016/0092-8674(95)90339-9. PMID  7736581. S2CID  11114706.
  7. ^ Torres VE, Harris PC, Pirson Y (aprel 2007). "Autozomal dominant polikistik buyrak kasalligi". Lanset. 369 (9569): 1287–301. doi:10.1016 / S0140-6736 (07) 60601-1. PMID  17434405. S2CID  1700992.
  8. ^ a b v Chjou J (2009). "Polikistinlar va birlamchi kirpiklar: hujayra tsiklining progresiyasi". Fiziologiyaning yillik sharhi. 71: 83–113. doi:10.1146 / annurev.physiol.70.113006.100621. PMID  19572811.
  9. ^ Dalagiorgou G, Basdra EK, Papavassiliou AG (oktyabr 2010). "Polikistin-1: mexanosensor vazifasi". Xalqaro biokimyo va hujayra biologiyasi jurnali. 42 (10): 1610–3. doi:10.1016 / j.biocel.2010.06.017. PMID  20601082.
  10. ^ Trudel M, Yao Q, Qian F (yanvar 2016). "Buyrak fiziologiyasi va buyrak polikistozi kasalliklarida G-oqsil bilan bog'langan retseptorlari proteolitik joyida polikistin-1ni parchalashning roli". Hujayralar. 5 (1): 3. doi:10.3390 / hujayralar5010003. PMC  4810088. PMID  26805887.
  11. ^ Chauvet V, Tian X, Xusson H, Grimm DH, Vang T, Hiesberger T, Hieseberger T, Igarashi P, Bennet AM, Ibragimov-Beskrovnaya O, Somlo S, Caplan MJ (2004 yil noyabr). "Mexanik stimullar polikistin-1 S terminalining bo'linishi va yadro translokatsiyasini keltirib chiqaradi". Klinik tadqiqotlar jurnali. 114 (10): 1433–43. doi:10.1172 / JCI21753. PMC  1052027. PMID  15545994.
  12. ^ Low SH, Vasanth S, Larson CH, Mukherjee S, Sharma N, Kinter MT, Keyn ME, Obara T, Weimbs T (yanvar 2006). "Polikistin-1, STAT6 va P100 siliyer mexanosensatsiyasini o'tkazadigan va buyrakning polikistik kasalligida faollashadigan yo'lda ishlaydi". Rivojlanish hujayrasi. 10 (1): 57–69. doi:10.1016 / j.devcel.2005.12.005. PMID  16399078.
  13. ^ Lal M, Song X, Pluznik JL, Di Giovanni V, Merrick DM, Rozenblum ND, Chauvet V, Gottardi CJ, Pei Y, Caplan MJ (oktyabr 2008). "Polikistin-1 C-terminal dumi beta-katenin bilan birikadi va Wnt kanonik signalizatsiyasini inhibe qiladi". Inson molekulyar genetikasi. 17 (20): 3105–17. doi:10.1093 / hmg / ddn208. PMC  2722884. PMID  18632682.
  14. ^ Shi, Yigong; Mei, Changlin; Chjou, Tsian; Vang, Tingliang; Yu, Shengtsyan; Ley, Tszyanlin; Ge, Xiaofei; Xu, Feyzxu; Qiangning Su (2018-09-07). "Insonning PKD1-PKD2 kompleksining tuzilishi". Ilm-fan. 361 (6406): eaat9819. doi:10.1126 / science.aat9819. ISSN  0036-8075. PMID  30093605.
  15. ^ Nauli SM, Alenghat FJ, Luo Y, Uilyams E, Vassilev P, Li X, Elia AE, Lu V, Braun EM, Kvinn SJ, Ingber DE, Chjou J (fevral 2003). "1 va 2-sonli polikistinlar buyrak hujayralarining birlamchi siliyasida mexanosensatsiyani vositachilik qiladi". Tabiat genetikasi. 33 (2): 129–37. doi:10.1038 / ng1076. PMID  12514735. S2CID  23149223.
  16. ^ "Entrez Gen: PKD1 buyrak polikistik kasalligi 1 (autosomal dominant)".

Tashqi havolalar