Polineuridin-aldegid esteraza - Polyneuridine-aldehyde esterase
| polinevridin-aldegid esteraza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Polyneuridine-Aldehyde Esterase 3D Rendering | |||||||||
| Identifikatorlar | |||||||||
| EC raqami | 3.1.1.78 | ||||||||
| CAS raqami | 87041-55-2 | ||||||||
| Ma'lumotlar bazalari | |||||||||
| IntEnz | IntEnz ko'rinishi | ||||||||
| BRENDA | BRENDA kirish | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme ko'rinishi | ||||||||
| KEGG | KEGG-ga kirish | ||||||||
| MetaCyc | metabolik yo'l | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB tuzilmalar | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Gen ontologiyasi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Yilda enzimologiya, a polinevridin-aldegid esteraza (EC 3.1.1.78 ) an ferment bu kataliz qiladi The kimyoviy reaktsiya:
- polinevidin aldegid + H2O 16-epivellosimin + CO2 + metanol
Shunday qilib, ikkalasi substratlar bu fermentdan polinevidin aldegid va H2O, uchtasi esa mahsulotlar 16-epivellosimin, CO2 va metanol.[1]
Ushbu ferment indol va ipekak alkaloid biosintezida ishtirok etadi.
Nomenklatura
Ushbu ferment. Oilasiga tegishli gidrolazalar, xususan karboksilikda ishlaydiganlar Ester obligatsiyalar. The sistematik ism Ushbu fermentlar sinfining polinevridin aldegid gidrolazasi (dekarboksilatlash). Umumiy ishlatiladigan boshqa nomlarga quyidagilar kiradi:
- polinevridin aldegid esteraza
- PNAE
Gomologlar
Ushbu ferment turli xil shakllarda o'simlik turlarida uchraydi Arabidopsis talianasi, Glycine max (soya), Vitis vinifera (sharob uzum) va Solanum lycopersicum (pomidor) boshqalar qatorida.
Polineuridin-aldegid esteraza, shu jumladan tanlangan bakteriyalarda ham uchraydi Enterobakteriya kloakasi.
Tuzilishi
Ushbu fermentning ikkilamchi tuzilishi asosan quyidagilardan iborat alfa spirallari. O'zining asl shaklida bu ferment ikkita asosiy lobni o'z ichiga olgan uchinchi darajali tuzilishga ega (yuqoridagi o'ngdagi ko'k 3D tasvirida yuqorida ko'rsatilganidek).
Reaksiya
 |  |  |
![{displaystyle {xrightarrow [{+ H_ {2} O -CH_ {3} OH}] {polineuridine-aldehyde esterase}}}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/c531b2f1ef50a92e2bc339985a2930889e6e7c00)
![{displaystyle {xrightarrow [{- CO_ {2}}] {}}}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/b07e25d5081c7cd1888da626b44147b66762db17)
Polineuridin-aldegid esteraza katalizlaydi gidroliz ning metil Ester polinevridin aldegidida polineuridin b-aldegidatsid va metanol hosil qiladi. The karboksilik kislota mahsulotda o'z-o'zidan paydo bo'ladi dekarboksilatsiya, 16-epivellosimin va karbonat angidrid hosil qiladi.[1]
Mexanizm
Polineuridin-aldegid esteraza tomonidan bajariladigan gidroliz mexanizmi ma'lum emas. Ferment a dan foydalanadi deb taxmin qilingan katalitik uchlik Ser-87, Asp-216 va His-244 dan tashkil topgan.[3] Katalitik aminokislota tartibi, uning tarkibiga kiradigan fermentlarning tartibi bilan bir xil a / b gidrolaza oila. Shunday qilib polineuridin-aldegid esteraza a / b gidrolaz guruhining yangi a'zosi bo'lishi mumkin.[4]
Kengroq ahamiyatga ega
Ushbu ferment bu yo'lning bir qismidir indol alkaloid biosintez. Ushbu metabolik yo'l natijasida hosil bo'lgan indol alkaloidlari ko'plab o'simlik turlari tomonidan o'txo'rlar va parazitlardan himoya sifatida foydalaniladi.
Ochiq savollar
Ushbu ferment o'z funktsiyasini bajaradigan aniq mexanizmlar hali noma'lum. Yuqorida ta'kidlab o'tilganidek, tadqiqotchilar polineuridin-aldegid esteraza polineuridin-aldegidning parchalanishini katalizatori haqida takliflarni ishlab chiqmoqdalar, ammo bu mexanizm hali aniq ishonch bilan tasdiqlanmagan. Polineuridin-aldegid esterazaning aniq mexanizmini to'liq anglamaganligi sababli, bu fermentni fermentlar oilasiga birlashtirish mumkin emas. Mexanizm nazariyalariga asoslanib, ushbu fermentni qanday toifalarga ajratish kerakligi to'g'risida takliflar kiritilishi mumkin va polinevidin-aldegid esteraza va boshqa fermentlar o'rtasida ba'zi o'xshashliklar bo'lishi mumkin.
Adabiyotlar
- ^ a b Pfitzner A, Stockigt J (avgust 1983). "Sarpagin / ajmalin tipidagi alkaloidlarning biosintezidagi asosiy ferment - polinevidin aldegid esteraza xarakteristikasi". Planta Med. 48 (8): 221–7. doi:10.1055 / s-2007-969924. PMID 17404987.
- ^ PDB: 3GZJ; Yang L, Hill M, Vang M, Panjikar S, Stockigt J (2009). "C10-monoterpenoid indol alkaloidlaridan C9- ning biosintezining strukturaviy asoslari va fermentativ mexanizmi". Angew. Kimyoviy. Int. Ed. Ingl. 48 (28): 5211–3. doi:10.1002 / anie.200900150. PMID 19496101.
- ^ Mattern-Dogru E, Ma X, Hartmann J, Decker H, Stockigt J (iyun 2002). "Polinevidin aldegid esteraza, indol alkaloid biosintezining markaziy fermenti bo'lgan potentsial faol joy qoldiqlari, modellashtirish va saytga yo'naltirilgan mutagenez orqali". Yevro. J. Biokimyo. 269 (12): 2889–96. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.02956.x. PMID 12071952.
- ^ Dogru E, Warzecha H, Seibel F, Haebel S, Lottspeich F, Stockigt J (mart 2000). "O'simliklardagi monoterpenoid indol alkaloid biosintezining polineuridin aldegid esterazasini kodlovchi gen alfa / betahidrolaza super oilasining orlogidir". Yevro. J. Biokimyo. 267 (5): 1397–406. doi:10.1046 / j.1432-1327.2000.01136.x. PMID 10691977.
Qo'shimcha o'qish
- Pfitzner A, Stockigt J (1983). "Polineuridin aldegid esteraza: sarpagin tipidagi alkaloidlarning biosintezida ishtirok etadigan o'ziga xos bo'lmagan ferment". Kimyoviy jamiyat jurnali, kimyoviy aloqa (8): 459–460. doi:10.1039 / C39830000459.
