SYCP3 - SYCP3

SYCP3
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarSYCP3, COR1, SCP3, SPGF4, RPRGL4, sinaptonemal kompleks oqsil 3
Tashqi identifikatorlarOMIM: 604759 MGI: 109542 HomoloGene: 7964 Generkartalar: SYCP3
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 12 (odam)
Chr.Xromosoma 12 (odam)[1]
Xromosoma 12 (odam)
SYCP3 uchun genomik joylashuv
SYCP3 uchun genomik joylashuv
Band12q23.2Boshlang101,728,648 bp[1]
Oxiri101,739,472 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE SYCP3 gnf1h02670

Fs.png da PBB GE SYCP3 gnf1h02671 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001177948
NM_001177949
NM_153694

NM_011517

RefSeq (oqsil)

NP_001171419
NP_001171420
NP_710161

NP_035647

Joylashuv (UCSC)Chr 12: 101.73 - 101.74 MbChr 10: 88.46 - 88.47 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Sinaptonemal kompleks oqsil 3 a oqsil odamlarda kodlanganligi SYCP3 gen.[5][6][7] Bu. Ning tarkibiy qismidir sinaptonemal kompleks davomida gomologik xromosomalar orasida hosil bo'lgan profaza ning mayoz.[8]

Genlar oilasi

XLR / SYCP3 / FAM9 domeni
Identifikatorlar
BelgilarCor1
PfamPF04803
InterProIPR006888
KATH4 dona

SYCP3 COR1 nomi bilan ham tanilgan. U tarkibida FAM9 da saqlangan saqlangan o'ralgan spiral domeni mavjud (FAM9A, FAM9B ) inson X xromosomasida joylashgan oqsillar oilasi.[5]

Sichqonlarning jinsiy xromosomalarida SYCP3 ga o'xshash bir nechta oqsillar mavjud. Ularga bog'langan xromosomaga qarab Slx yoki Sly dan boshlanadigan ismlar beriladi. Slx / Slxl1 va Sly genlarning ekspressioni va epigenetik modifikatsiyalariga teskari ta'sir ko'rsatadigan neofunktsionalizatsiya qilingan va har bir gen hayotiyligini va harakatchanligini kamaytiradi (orqali spindlin boshqa jinsiy xromosomani o'z ichiga olgan spermatozoidlarni bog'lash), jinsiy nisbatni o'z foydasiga burish.[9] Vaqt o'tishi bilan ular bir-birining ta'sirini muvozanatlash uchun takrorlanadi.[10]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000139351 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000020059 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b Martinez-Garay I, Jablonka S, Sutajova M, Steuernagel P, Gal A, Kutsche K (sentyabr 2002). "Xp22.3-dagi past nusxada takrorlanadigan yangi genlar oilasi (FAM9) faqat moyaklar bilan ifodalangan: ushbu mintaqadagi rekombinatsiyalarga ta'siri". Genomika. 80 (3): 259–67. doi:10.1006 / geno.2002.6834. PMID  12213195.
  6. ^ Mallon AM, Platzer M, Bate R, Gloeckner G, Botcherby MR, Nordsiek G va boshq. (Iyun 2000). "Sichqoncha va odamda Bpa / Str mintaqasining genom ketma-ketligini taqqoslash". Genom tadqiqotlari. 10 (6): 758–75. doi:10.1101 / gr.10.6.758. PMC  310879. PMID  10854409.
  7. ^ "Entrez Gen: SYCP3 sinaptonemal kompleks oqsil 3".
  8. ^ Syrjänen JL, Pellegrini L, Devies OR yoki (iyun 2014). "Meyozli xromosomalarni tashkil etishda SYCP3 ning roli uchun molekulyar model". eLife. 3. doi:10.7554 / eLife.02963. PMC  4102245. PMID  24950965.
  9. ^ Cocquet J, Ellis PJ, Mahadevaiah SK, Affara NA, Vaiman D, Burgoyne PS (sentyabr 2012). "Postmeyotik X va Y xromosomalarining sichqonchadagi intragenomik to'qnashuvi uchun genetik asos". PLOS Genetika. 8 (9): e1002900. doi:10.1371 / journal.pgen.1002900. PMC  3441658. PMID  23028340.
  10. ^ Kruger AN, Brogli MA, Huizinga JL, Kidd JM, de Rooij DG, Xu YC, Myuller JL (oktyabr, 2019). "Neofunktsionalizatsiya qilingan X-bog'langan Amplikonik genlar oilasi erkaklarning serhosilligi va sichqonlarda jinsning teng nisbati uchun muhimdir". Hozirgi biologiya. 29 (21): 3699-3706.e5. doi:10.1016 / j.cub.2019.08.057. PMC  7012382. PMID  31630956.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar

  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: Q8IZU3 (Inson sinaptonemali kompleks oqsil 3) da PDBe-KB.
  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: P70281 (Sichqoncha sinaptonemali kompleks oqsil 3) da PDBe-KB.