Sortilin 1 - Sortilin 1 - Wikipedia

SORT1
Protein SORT1 PDB 3F6K.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarSORT1, Gp95, LDLCQ6, NT3, NTR3, Sortilin 1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 602458 MGI: 1338015 HomoloGene: 136097 Generkartalar: SORT1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 1 (odam)
Chr.Xromosoma 1 (odam)[1]
Xromosoma 1 (odam)
Genomic location for SORT1
Genomic location for SORT1
Band1p13.3 | 1p21.3-p13.1Boshlang109,309,568 bp[1]
Oxiri109,397,918 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE SORT1 212797 at fs.png

PBB GE SORT1 212807 s at fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001205228
NM_002959

NM_001271599
NM_019972

RefSeq (oqsil)

NP_001192157
NP_002950

NP_001258528
NP_064356

Joylashuv (UCSC)Chr 1: 109.31 - 109.4 MbChr 3: 108.28 - 108.36 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Sortilin (SORT1) a oqsil odamlarda kodlanganligi SORT1 gen kuni xromosoma 1.[5] Ushbu protein I turdagi membranadir glikoprotein ichida vakuolyar oqsillarni saralash 10 ta protein (Vps10p) saralash retseptorlari oilasi. U hamma joyda ko'p to'qimalarda ifodalangan bo'lsa-da,[6] sortilin tarkibida eng ko'p uchraydi markaziy asab tizimi.[7] Uyali darajada sortilin oqsillarni transportirovkalashda funktsiyalarini bajaradi Golgi apparati, endosoma, lizosoma va plazma membranasi kabi ko'plab biologik jarayonlarda ishtirok etishiga olib keladi glyukoza va lipid metabolizmi shu qatorda; shu bilan birga asabiy rivojlanish va hujayralar o'limi.[8][9][10][11][12] Bundan tashqari, sortilinning funktsiyasi va roli hozirgi kunda insonning bir qator asosiy kasalliklarida paydo bo'lmoqda ateroskleroz va koronar arteriya kasalligi, Altsgeymer kasalligi va saraton.[13][14][15] The SORT1 gen, shuningdek, 27 dan birini o'z ichiga oladi lokuslar koronar arter kasalligi xavfi ortishi bilan bog'liq.[16]

Tuzilishi

Gen

The SORT1 gen xromosomada 1p13.3 bandida joylashgan bo'lib, 23 ni o'z ichiga oladi exons.[5] Ushbu gen 2 ni kodlaydi izoformlar orqali muqobil qo'shish.[17]

Oqsil

Sortilin Vps10p saralash retseptorlari oilasining a'zosi.[7] Kristallanish oqsilni o'rganish shuni ko'rsatadiki, bilan murakkablashganda ligand neyrotensin, Vps10 ektodomain sortilin ichki tunnel bilan bir nechta ligandni o'z ichiga olgan o'nta pichoqli beta-pervanel strukturasini hosil qiladi majburiy saytlar.[18] Uning davomida ligandning erta bog'lanishini oldini olish uchun sintez, kashshof oqsil sortilin tarkibida 44-aminokislota pro-peptid sifatida xizmat qiladi chaperone Vps10p domeni uchun.[19] Bundan tashqari, ikkitasi hidrofobik ilmoqlar Ushbu sohada aniqlangan va hujayra membranasidagi oqsilni biriktirishga harakat qiladi.[20] Shuningdek, Sortilin konformatsion o'zgarishga uchraganligi va a hosil bo'lishi ko'rsatilgan oqsil dimer da topilganlarga o'xshash kislotali sharoitda endosoma, pH qiymati past ligandning chiqarilishi uchun ikki tomonlama mexanizmni ko'rsatadigan va ehtimol retseptorni qayta ishlashga ishora qiluvchi. [21]

Funktsiya

Odamlarda sortilin hujayralar va to'qimalar kabi keng doiralarda namoyon bo'ladi miya, orqa miya, buyrak usti bezi, qalqonsimon bez, B-limfotsitlar, adipotsitlar, skelet mushaklari va yurak.[22] Saralash retseptorlari sifatida hujayra yuzasi va endoplazmatik to'r - Hujayra ichidagi kolgi apparati, sortilin tarkibiga kiradi transport trans-Golji tarmog'i, endosoma, lizosoma va sekretor granulalar, shuningdek plazma membranasi.[8] Ushbu molekulyar funktsiya sortilinning turli xil biologik jarayonlarda, shu jumladan transportda ishtirok etishiga imkon beradi GLUT4 ning plazma membranasiga yog ' va skelet mushak hujayralari bunga javoban insulin.[9] Shuningdek, u o'zaro aloqada vositachilik qiladi proNGF va p75NTR: sortilin murakkab sifatida harakat qilib birgalikda retseptorlari hujayraning o'limi to'g'risida signal berish.[12][19] Ning nozik regulyatsiyasi miyadan kelib chiqadigan neyrotrofik omil (BDNF) sortilin bilan neyronal va uchun zarur o'simta hujayrasi omon qolish.[23] Bundan tashqari, sortilin bilan bog'liq LDL -xolesterin metabolizm, VLDL sekretsiya va PCSK9 sekretsiya va shu bilan aterosklerotik rivojlanishida rol o'ynaydi jarohatlar.[10][11] Sortilin bilan bog'liq boshqa jarayonlarga quyidagilar kiradi endotsitoz,[8] ning salbiy regulyatsiyasi lipoprotein lipaza faoliyat,[24] myotube farqlash,[25] suyaklanish,[26] va tartibga solish gen ekspressioni.[25]

Klinik ahamiyati

Yengillashtirishda uning funktsiyasini hisobga olgan holda lizosomal degradatsiya yoki lipid metabolizmasidagi ligandlarni qayta ishlash[11][13][27][28][29] va asab tizimi,[30] sortilin, ehtimol asosiy mexanizmlarda muhim rol o'ynaydi va patofiziologiya aterogenez va koronar arteriya kasalligi, shuningdek asab kasalliklari. Masalan, sortilin miya uchun muhim retseptor sifatida aniqlangan apolipoprotein E Altsgeymer kasalligining asosiy mexanizmlarida ishtirok etadigan (APOE) metabolizm.[30][31][32][33] Yaqinda shuningdek, sortilin uchun muhim rol haqida xabar berilgan onkologiya, chunki bir nechtasida aniqlangan saraton hujayralari chiziqlari. Ta'kidlash joizki, inson saraton kasalligi epiteliya hujayralari oddiy epiteliya to'qimalariga nisbatan sortilin darajasi oshdi. Bundan tashqari, sortilin ning rivojlanishida ishtirok etadi ko'krak bezi saratoni va shish paydo bo'lishiga yordam beradi hujayraning yopishishi va bosqinchilik.[14][15]

Klinik marker

2007 yilda 1p13.3 xromosomasi a orqali istiqbolli joy sifatida aniqlandi genom bo'yicha koroner arter kasalligi bo'lgan bemorlarga yondashuv.[34] Keyinchalik, dalillarni to'plash shuni ko'rsatadiki SORT1 1p13 lokusidagi gen koronar arteriya kasalligi uchun muhim xavf omilidir lipid metabolizmining buzilishi.[34][35][36] Lipit metabolizmida va ateroskleroz rivojlanishida sortilinning roli aniqlanganligi sababli, yaqinda o'tkazilgan bir tadqiqot, trombotsitlardan aylanadigan sortilin sifatida o'lchanadigan eriydigan sortilinning ko'payishi in vivo jonli trombotsitlarning faollashishi bilan bog'liq bo'lishi mumkinligi haqida xabar berdi.[37] Ushbu kuzatuv shuningdek, sortilinning diagnostika va prognoz uchun klinik biomarker sifatida potentsial dasturga ega ekanligini ko'rsatadi.[10][37] Bundan tashqari, 27 lokusning kombinatsiyasiga asoslangan ko'p joyli genetik xavf skorini o'rganish SORT1 gen, aniqlangan shaxslar, ham hodisa, ham takrorlanadigan koronar arteriya kasalliklari xavfi yuqori, shuningdek klinik foyda yaxshilanadi statin terapiya. Tadqiqot jamoatchilikka asoslangan edi kohort o'rganish (Malmo dietasi va saraton kasalligini o'rganish) va to'rtta qo'shimcha randomizatsiyalangan boshqariladigan sinovlar oldini olish bo'yicha birlamchi kogortalar (JUPITER va ASCOT) va ikkilamchi profilaktika kogortalari (CARE va PROVE IT-TIMI 22).[16]

O'zaro aloqalar

Sortilin ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan GGA1[38] va GGA2.[8][38]

Interaktiv yo'l xaritasi

Sortilin ichidagi o'zaro aloqalarda ishtirok etadi trans-Golgi tarmog'i pufakchalari va BDNF signalizatsiya yo'llari.

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000134243 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000068747 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b "Entrez Gen: SORT1 sortilin 1".
  6. ^ "BioGPS - sizning gen portalingiz tizimi". biogps.org. Olingan 2016-08-16.
  7. ^ a b Andersen JL, Schrøder TJ, Kristensen S, Strandbygard D, Pallesen LT, Gartsiya-Oloy MM, Lindberg S, Langgard M, Eskildsen JK, Devid L, Tagmose L, Simonsen KB, Maltas PJ, Ronn LC, de Yong IE, Malik IJ , Egebjerg J, Karlsson JJ, Uppalanchi S, Sakumudi DR, Eradi P, Watson SP, Thirup S (Fevral 2014). "Nöronal retseptorlari sortilinining birinchi kichik molekulali ligandini aniqlash va retseptorlari-ligand kompleksining tuzilishini aniqlash". Acta Crystallographica bo'limi D. 70 (Pt 2): 451-60. doi:10.1107 / S1399004713030149. PMC  3940197. PMID  24531479.
  8. ^ a b v d Nilsen MS, Madsen P, Kristensen EI, Nykjaer A, Gliemann J, Kasper D, Pohlmann R, Petersen CM (may 2001). "Sortilin sitoplazmatik quyruq Golgi-endosoma transportini etkazib beradi va GGA2 saralash oqsilining VHS domenini bog'laydi". EMBO jurnali. 20 (9): 2180–90. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2180. PMC  125444. PMID  11331584.
  9. ^ a b Xuang G, Bakler-Pena D, Nauta T, Singx M, Asmar A, Shi J, Kim JY, Kandror KV (oktyabr 2013). "3T3-L1 hujayralaridagi glyukoza tashuvchisi 4 ning insulin ta'sirchanligi sortilin mavjudligiga bog'liq". Hujayraning molekulyar biologiyasi. 24 (19): 3115–22. doi:10.1091 / mbc.E12-10-0765. PMC  3784384. PMID  23966466.
  10. ^ a b v Patel KM, Strong A, Tohyama J, Jin X, Morales CR, Billgeymer J, Millar J, Krut H, Rader DJ (fevral, 2015). "Makrofag sortilin LDLni qabul qilish, ko'pik hujayralari shakllanishi va aterosklerozga yordam beradi". Sirkulyatsiya tadqiqotlari. 116 (5): 789–96. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.116.305811. PMC  4602371. PMID  25593281.
  11. ^ a b v Kjolby M, Nilsen MS, Petersen CM (aprel 2015). "Sortilin, yurak-qon tomir xavfi geni SORT1 tomonidan kodlangan va uning yurak-qon tomir kasalliklarida tavsiya etilgan funktsiyalari". Ateroskleroz bo'yicha joriy hisobotlar. 17 (4): 496. doi:10.1007 / s11883-015-0496-7. PMID  25702058.
  12. ^ a b Nykjaer A, Lee R, Teng KK, Jansen P, Madsen P, Nielsen MS, Jacobsen C, Kliemannel M, Schwarz E, Willnow TE, Hempstead BL, Petersen CM (Fevral 2004). "Sortilin proNGF ta'sirida neyronal hujayralar o'limi uchun juda muhimdir". Tabiat. 427 (6977): 843–8. doi:10.1038 / nature02319. PMID  14985763.
  13. ^ a b Goettsch C, Hutcheson JD, Aikawa M, Iwata H, Pham T, Nykjaer A, Kjolby M, Rogers M, Michel T, Shibasaki M, Hagita S, Kramann R, Rader DJ, Libby P, Singh SA, Aikawa E (aprel 2016) ). "Sortilin hujayradan tashqaridagi pufakchalarga qo'shilish orqali tomirlarning kalsifikatsiyasiga vositachilik qiladi". Klinik tadqiqotlar jurnali. 126 (4): 1323–36. doi:10.1172 / JCI80851. PMC  4811143. PMID  26950419.
  14. ^ a b Roselli S, Pundavela J, Demont Y, Folkner S, Keene S, Attia J, Jiang CC, Zhang XD, Walker MM, Hondermarck H (aprel, 2015). "Sortilin ko'krak bezi saratonining tajovuzkorligi bilan bog'liq bo'lib, o'sma hujayralarining yopishqoqligi va invaziyasiga yordam beradi".. Onkotarget. 6 (12): 10473–86. doi:10.18632 / oncotarget.3401. PMC  4496368. PMID  25871389.
  15. ^ a b Uilson CM, Naves T, Al Axras H, Vinsent F, Melloni B, Bonnaud F, Lalloué F, Jaubertoau MO (2016-02-01). "Saraton kasalligida sortilin kamaridagi yangi rol". Kommunikativ va integral biologiya. 9 (1): e1130192. doi:10.1080/19420889.2015.1130192. PMC  4802778. PMID  27066187.
  16. ^ a b Mega JL, Stitsiel NO, Smit JG, Chasman DI, Kolfild MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (Iyun 2015). "Genetik xavf, yurak tomirlari kasalliklari va statin terapiyasining klinik foydasi: birlamchi va ikkilamchi profilaktika sinovlari tahlili". Lanset. 385 (9984): 2264–71. doi:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. PMC  4608367. PMID  25748612.
  17. ^ "SORT1 - Sortilin prekursori - Homo sapiens (Inson) - SORT1 geni va oqsili". www.uniprot.org. Olingan 2016-08-16.
  18. ^ Quistgaard EM, Madsen P, Grøftehauge MK, Nissen P, Petersen CM, Thirup SS (yanvar 2009). "Ligandlar Sortilin bilan o'nta pichoqli beta-parvona domeni tunnelida bog'lanadi". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 16 (1): 96–8. doi:10.1038 / nsmb.1543. PMID  19122660.
  19. ^ a b Nykjaer A, Willnow TE (aprel 2012). "Sortilin: neyronlarning hayotiyligi va funktsiyasini tartibga soluvchi retseptor". Nörobilimlerin tendentsiyalari. 35 (4): 261–70. doi:10.1016 / j.tins.2012.01.003. PMID  22341525.
  20. ^ Quistgaard EM, Grøftehauge MK, Madsen P, Pallesen LT, Kristensen B, Sorensen ES, Nissen P, Petersen CM, Thirup SS (sentyabr 2014). "Odam sortilinining Vps10 domeni tuzilishini va uning neyrotensin bilan o'zaro ta'sirini qayta ko'rib chiqish". Proteinli fan. 23 (9): 1291–300. doi:10.1002 / pro.2512. PMC  4243999. PMID  24985322.
  21. ^ Leloup N, Loessl P, Meijer DH, Brennich M, Heck AJ, Thies-Weesie DM, Yanssen BJ (noyabr 2017). "Past pH ta'siridagi konformatsion o'zgarish va sortilinning dimerizatsiyasi endotsitozli ligandning tarqalishini keltirib chiqaradi". Tabiat aloqalari. 8 (1708). doi:10.1038 / s41467-017-01485-5. PMC  5700061. PMID  29167428.
  22. ^ Shmidt V, Willnow TE (fevral 2016). "Proteinlarni saralash noto'g'ri ketdi - yurak-qon tomir va metabolik kasalliklarda VPS10P domen retseptorlari" (PDF). Ateroskleroz. 245: 194–9. doi:10.1016 / j.ateroskleroz.2015.11.027. PMID  26724530.
  23. ^ Akil H, Perraud A, Mélin C, Jauberteau MO, Mathonnet M (2011-01-01). "Kollektal saraton hujayralarida omon qolish uchun endogen miyadan kelib chiqadigan neyrotrofik omil, TrkB va sortilinning aniq sozlanishi". PLOS ONE. 6 (9): e25097. doi:10.1371 / journal.pone.0025097. PMC  3180371. PMID  21966426.
  24. ^ Nilsen MS, Jacobsen C, Olivecrona G, Gliemann J, Petersen CM (mart 1999). "Sortilin / nörotensin retseptorlari-3 lipoprotein lipazning parchalanishini bog'laydi va vositachilik qiladi". Biologik kimyo jurnali. 274 (13): 8832–6. doi:10.1074 / jbc.274.13.8832. PMID  10085125.
  25. ^ a b Ariga M, Nedachi T, Katagiri H, Kanzaki M (aprel 2008). "Miogenezdagi sortilinning funktsional roli va C2C12 miotsitlarida insulinga sezgir glyukoza tashish tizimini rivojlantirish". Biologik kimyo jurnali. 283 (15): 10208–20. doi:10.1074 / jbc.M710604200. PMID  18258592.
  26. ^ Maeda S, Nobukuni T, Shimo-Onoda K, Hayashi K, Yone K, Komiya S, Inoue I (oktyabr 2002). "Sortilin mezenximal ildiz hujayralarini osteoblastik differentsiatsiyasi jarayonida tartibga solinadi va hujayradan tashqari matritsali minerallashuvga yordam beradi". Uyali fiziologiya jurnali. 193 (1): 73–9. doi:10.1002 / jcp.10151. PMID  12209882.
  27. ^ Strong A, Rader DJ (iyun 2012). "Sortilin lipoprotein metabolizmining regulyatori sifatida". Ateroskleroz bo'yicha joriy hisobotlar. 14 (3): 211–8. doi:10.1007 / s11883-012-0248-x. PMC  7089359. PMID  22538429.
  28. ^ Zhong LY, Cayabyab FS, Tang CK, Zheng XL, Peng TH, Lv YC (2016 yil sentyabr). "Sortilin: lipidlar almashinuvi va aterogenezdagi yangi regulyator". Clinica Chimica Acta. 460: 11–7. doi:10.1016 / j.cca.2016.06.013. PMID  27312323.
  29. ^ Kjolby M, Andersen OM, Breiderhoff T, Fjorback AW, Pedersen KM, Madsen P, Jansen P, Heeren J, Willnow TE, Nykjaer A (sentyabr 2010). "1p13.3 yurak-qon tomir xavfi bilan kodlangan Sort1 jigar lipoproteinlari eksportining regulyatoridir". Hujayra metabolizmi. 12 (3): 213–23. doi:10.1016 / j.cmet.2010.08.006. PMID  20816088.
  30. ^ a b Karlo AS (2013-10-01). "Sortilin, Altsgeymer kasalligiga aloqador yangi APOE retseptorlari". Prion. 7 (5): 378–82. doi:10.4161 / pri.26746. PMC  4134342. PMID  24121631.
  31. ^ Jin S, Liu X, Zhang F, Vu Y, Yuan J, Zhu J, Zhang F, Van G, Cheng Z (2013-01-01). "SORL1 variantlari va sporadik Altsgeymer kasalligi xavfi o'rtasidagi bog'liqlikning yangilangan meta-tahlili". Altsgeymer kasalligi jurnali. 37 (2): 429–37. doi:10.3233 / JAD-130533. PMID  23948893.
  32. ^ Piscopo P, Tosto G, Belli C, Talarico G, Galimberti D, Gasparini M, Canevelli M, Poleggi A, Crestini A, Albani D, Forloni G, Lucca U, Quadri P, Tettamanti M, Fenoglio C, Scarpini E, Bruno G , Vanacore N, Confaloni A (2015-01-01). "SORL1 geni engil kognitiv zaiflashuvdan Altsgeymer kasalligiga o'tish bilan bog'liq". Altsgeymer kasalligi jurnali. 46 (3): 771–6. doi:10.3233 / JAD-141551. PMID  25881907.
  33. ^ Andersson CH, Xansson O, Minton L, Andreasen N, Blennov K, Zetterberg H, Skoog I, Uollin A, Nilsson S, Kettunen P (2016 yil iyul). "Sortilin 1 genining genetik varianti Altsgeymer kasalligining pasayishi xavfi bilan bog'liq". Altsgeymer kasalligi jurnali. 53: 1353–63. doi:10.3233 / JAD-160319. PMC  5147507. PMID  27392867.
  34. ^ a b Samani NJ, Erdmann J, Hall AS, Xengstenberg C, Mangino M, Mayer B, Dikson RJ, Meitinger T, Braund P, Vichmann HE, Barret JH, König IR, Stivens SE, Szymczak S, Tregouet DA, Iles MM, Pahlke F , Pollard H, Lieb V, Kambien F, Fischer M, Ouwehand V, Blankenberg S, Balmfort AJ, Baessler A, Ball SG, Strom TM, Braenne I, Gieger C, Deloukas P, Tobin MD, Ziegler A, Tompson JR, Shunkert H (2007 yil avgust). "Koronar arteriya kasalligini genomewide assotsiatsiyasi tahlili". Nyu-England tibbiyot jurnali. 357 (5): 443–53. doi:10.1056 / NEJMoa072366. PMC  2719290. PMID  17634449.
  35. ^ Nikpay M, Goel A, Won HH, Hall LM, Willenborg C, Kanoni S va boshq. (Oktyabr 2015). "Koronar arteriya kasalligi bo'yicha genomga asoslangan 1000 genomga asoslangan keng meta-tahlil assotsiatsiyasi". Tabiat genetikasi. 47 (10): 1121–30. doi:10.1038 / ng.3396. PMC  4589895. PMID  26343387.
  36. ^ Zeller T, Blankenberg S, Diemert P (yanvar 2012). "Genomewide assotsiatsiyasi yurak-qon tomir kasalliklari bo'yicha tadqiqotlar - 2011 yil yangilanishi". Klinik kimyo. 58 (1): 92–103. doi:10.1373 / clinchem.2011.170431. PMID  22125304.
  37. ^ a b Ogawa K, Ueno T, Ivasaki T, Kujiraoka T, Ishihara M, Kunimoto S, Takayama T, Kanai T, Xirayama A, Hattori H (iyun 2016). "Eriydigan sortilin faollashtirilgan trombotsitlar tomonidan chiqariladi va uning aylanish darajasi yurak-qon tomir xavf omillari bilan bog'liq". Ateroskleroz. 249: 110–5. doi:10.1016 / j.ateroskleroz.2016.03.041. PMID  27085161.
  38. ^ a b Jacobsen L, Madsen P, Nielsen MS, Geraerts WP, Gliemann J, Smit AB, Petersen CM (yanvar 2002). "SorLA sitoplazmik domeni GGA1 va -2 bilan o'zaro ta'sir qiladi va GGA bilan bog'lanish uchun minimal talablarni belgilaydi". FEBS xatlari. 511 (1–3): 155–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9. PMID  11821067.

Qo'shimcha o'qish


Tashqi havolalar

  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: Q99523 (Sortilin) ​​da PDBe-KB.