Skitalidopepsin B - Scytalidopepsin B - Wikipedia

Skitalidokarboksil peptidaza B
Glutamik proteaz.png
Tarkibi skalidokarboksil peptidaza B, ajratilgan peptid bilan mahsulot qora va faol sayt qizil rangli glutamat-glutamin dyad yon zanjirlari. (PDB: 1S2K​)
Identifikatorlar
EC raqami3.4.23.32
CAS raqami104781-89-7
Ma'lumotlar bazalari
IntEnzIntEnz ko'rinishi
BRENDABRENDA kirish
ExPASyNiceZyme ko'rinishi
KEGGKEGG-ga kirish
MetaCycmetabolik yo'l
PRIAMprofil
PDB tuzilmalarRCSB PDB PDBe PDBsum

Skitalidokarboksil peptidaza B, shuningdek, nomi bilan tanilgan Skitalidoglutamik peptidaza va Skitalidopepsin B (EC 3.4.23.32, eskirgan ismlar kiradi Skitalidiy aspartik proteinaz B, Ganoderma lucidum karboksil proteinaz, Ganoderma lucidum aspartik proteinaz, Scytalidium lignicolum aspartik proteinaz B, SLB) a proteolitik ferment.[1][2][3][4][5] Ilgari u an aspartik proteaz, ammo uning molekulyar tuzilishini aniqlash uni yangi proteazlar guruhiga mansubligini ko'rsatdi, glutamik proteaz.[6][7]

Proteaza noyob tuzilishga ega va uning faol joyida yangi katalitik dyad (E136 va Q53) mavjud. Aktiv joy qoldiqlari - glutamik kislota (E) va glutamin (Q) oilasining nomini yaratish uchun ishlatilgan. proteazlar, ekolisinlar, unga Scytalidoglutamic peptidase B tegishli.[6]

Ushbu ferment katalizlar quyidagi kimyoviy reaktsiya

Gidroliz Phe-ni ajratib turadigan keng spetsifikatsiyaga ega oqsillar24-Phe va Tyr26–Tr, lekin Leu emas15-Tyr va Phe25-B ning zanjiridagi tir insulin. Bundan tashqari, u Hissani ajratib turadi6–Pro obligatsiyasi angiotensin I, P1 ′ holatida Pro bilan peptid bog'lanishini uzish qobiliyati g'ayrioddiy.

Bu endopeptidaza dan ajratilgan Scytalidium lignicolum. Bu kislota proteazidir va kazein substrat sifatida ishlatilganda pH 2.0 da eng faol bo'ladi. Ekolosinlar P1 uchastkasida katta miqdordagi aminokislota qoldiqlarini va P1 ′ uchastkasida kichik aminokislotalar qoldiqlarini afzal ko'rishadi.[8] Skitalidoglutamik peptidaza substratining o'ziga xos xususiyati, ayniqsa P3 (asosiy aminokislota), P1 ′ (kichik aminokislota) va P3 ′ (asosiy) pozitsiyalaridagi substrat imtiyozlarida noyobdir.[9]

Adabiyotlar

  1. ^ Terashita, T .; Oda, K .; Kono, M .; Murao, S. (1981). "Streptomitsiyalar pepsin ingibitoriga befarq karboksil proteinaz Lentinus tugunlari". Agric. Biol. Kimyoviy. 45: 1937–1943. doi:10.1271 / bbb1961.45.1937.
  2. ^ Mayta, T .; Nagata, S .; Matsuda, G.; Maruta, S .; Oda, K .; Murao, S .; Tsuru, D. (1984). "Ning to'liq aminokislotalar ketma-ketligi Scytalidium lignicolum kislota proteaz B ". J. Biokimyo. 95 (2): 465–473. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a134628. PMID  6370989.
  3. ^ Terashita, T .; Oda, K .; Kono, M .; Murao, S. (1984). "Streptomitsiyalar pepsin inhibitori sezgir bo'lmagan karboksil proteinaz Ganoderma lucidum". Agric. Biol. Kimyoviy. 48: 1029–1035. doi:10.1271 / bbb1961.48.1029.
  4. ^ Kobayashi, H.; Kusakabe, men.; Murakami, K. (1985). "Pepstatinga befarq karboksil proteinazani tozalash va tavsifi Polyporus tulipiferae (Irpex laktusi)". Agric. Biol. Kimyoviy. 49 (8): 2393–2397. doi:10.1271 / bbb1961.49.2393.
  5. ^ Tsuru, D .; Shimada, S .; Maruta, S .; Yoshimoto, T .; Oda, K .; Murao, S .; Miyata, T .; Iwanaga, S. (1986). "Epoksid-reaktiv qoldiqni o'z ichiga olgan peptidning izolyatsiyasi va aminokislotalar ketma-ketligi termoliz-dayjestidan Scytalidium lignicolum kislota proteaz B ". J. Biokimyo. 99 (5): 1537–1539. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a135624. PMID  3519605.
  6. ^ a b Masao Fujinaga; Maia M. Cherney; Xiroshi Oyama; Kohei Oda; Maykl N. G. Jeyms (2004). "Scytalidium lignicolum yangi karboksil peptidazasining molekulyar tuzilishi va katalitik mexanizmi". Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (10): 3364–9. doi:10.1073 / pnas.0400246101. PMC  373467. PMID  14993599.
  7. ^ Pillai B, Cherney MM, Xiraga K, Takada K, Oda K, Jeyms MN (2007). "Sitsalidoglutamik peptidazaning kristalli tuzilishi o'zining birinchi kuchli inhibitori bilan substratning o'ziga xosligi va katalizi to'g'risida tushuncha beradi". Molekulyar biologiya jurnali. 365 (2): 343-61. Epub 2006. doi:10.1016 / j.jmb.2006.09.058. PMID  17069854.
  8. ^ Kohei Oda (2012). "Karboksil peptidazalarning yangi oilalari: serin-karboksil peptidazalar va glutamik peptidazalar". Biokimyo jurnali. 151 (1): 13–25. doi:10.1093 / jb / mvr129. PMID  22016395.
  9. ^ Kataoka Y, Takada K, Oyama H, Tsunemi M, Jeyms MN, Oda K (2005). "Peptidazlar oilasida (G1) ekolisinning birinchi a'zosi bo'lgan sitalidoglutamik peptidazaning katalitik qoldiqlari va substrat o'ziga xosligi". FEBS Lett. 579 (14): 2991–4. doi:10.1016 / j.febslet.2005.04.050. PMID  15907842.

Tashqi havolalar